Protein–RNA interactions for Protein: Q91VK4

Itm2c, Integral membrane protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2cQ91VK4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itm2cQ91VK4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Itm2cQ91VK4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Itm2cQ91VK4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Itm2cQ91VK4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itm2cQ91VK4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itm2cQ91VK4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itm2cQ91VK4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itm2cQ91VK4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itm2cQ91VK4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itm2cQ91VK4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itm2cQ91VK4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itm2cQ91VK4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Itm2cQ91VK4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itm2cQ91VK4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itm2cQ91VK4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itm2cQ91VK4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itm2cQ91VK4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itm2cQ91VK4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Itm2cQ91VK4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itm2cQ91VK4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Itm2cQ91VK4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itm2cQ91VK4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itm2cQ91VK4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itm2cQ91VK4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itm2cQ91VK4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Itm2cQ91VK4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itm2cQ91VK4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itm2cQ91VK4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itm2cQ91VK4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itm2cQ91VK4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itm2cQ91VK4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itm2cQ91VK4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itm2cQ91VK4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itm2cQ91VK4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Itm2cQ91VK4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Itm2cQ91VK4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itm2cQ91VK4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itm2cQ91VK4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itm2cQ91VK4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itm2cQ91VK4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itm2cQ91VK4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itm2cQ91VK4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itm2cQ91VK4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Itm2cQ91VK4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Itm2cQ91VK4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itm2cQ91VK4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itm2cQ91VK4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itm2cQ91VK4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itm2cQ91VK4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itm2cQ91VK4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itm2cQ91VK4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itm2cQ91VK4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itm2cQ91VK4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itm2cQ91VK4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itm2cQ91VK4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itm2cQ91VK4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itm2cQ91VK4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itm2cQ91VK4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itm2cQ91VK4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itm2cQ91VK4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itm2cQ91VK4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itm2cQ91VK4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itm2cQ91VK4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itm2cQ91VK4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itm2cQ91VK4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itm2cQ91VK4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itm2cQ91VK4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itm2cQ91VK4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itm2cQ91VK4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itm2cQ91VK4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itm2cQ91VK4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Itm2cQ91VK4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itm2cQ91VK4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itm2cQ91VK4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itm2cQ91VK4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms