Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIM5

Myocd, Myocardin, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyocdQ8VIM5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MyocdQ8VIM5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MyocdQ8VIM5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MyocdQ8VIM5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MyocdQ8VIM5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MyocdQ8VIM5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MyocdQ8VIM5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MyocdQ8VIM5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MyocdQ8VIM5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MyocdQ8VIM5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MyocdQ8VIM5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MyocdQ8VIM5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MyocdQ8VIM5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MyocdQ8VIM5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MyocdQ8VIM5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MyocdQ8VIM5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MyocdQ8VIM5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MyocdQ8VIM5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MyocdQ8VIM5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MyocdQ8VIM5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MyocdQ8VIM5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MyocdQ8VIM5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MyocdQ8VIM5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MyocdQ8VIM5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MyocdQ8VIM5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MyocdQ8VIM5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MyocdQ8VIM5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MyocdQ8VIM5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MyocdQ8VIM5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MyocdQ8VIM5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MyocdQ8VIM5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MyocdQ8VIM5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MyocdQ8VIM5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MyocdQ8VIM5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MyocdQ8VIM5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MyocdQ8VIM5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MyocdQ8VIM5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MyocdQ8VIM5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MyocdQ8VIM5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MyocdQ8VIM5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MyocdQ8VIM5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MyocdQ8VIM5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MyocdQ8VIM5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MyocdQ8VIM5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MyocdQ8VIM5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MyocdQ8VIM5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MyocdQ8VIM5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MyocdQ8VIM5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MyocdQ8VIM5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MyocdQ8VIM5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MyocdQ8VIM5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MyocdQ8VIM5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MyocdQ8VIM5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MyocdQ8VIM5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MyocdQ8VIM5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MyocdQ8VIM5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MyocdQ8VIM5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MyocdQ8VIM5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MyocdQ8VIM5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MyocdQ8VIM5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MyocdQ8VIM5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MyocdQ8VIM5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MyocdQ8VIM5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MyocdQ8VIM5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MyocdQ8VIM5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MyocdQ8VIM5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MyocdQ8VIM5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MyocdQ8VIM5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MyocdQ8VIM5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MyocdQ8VIM5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MyocdQ8VIM5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MyocdQ8VIM5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MyocdQ8VIM5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MyocdQ8VIM5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MyocdQ8VIM5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MyocdQ8VIM5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MyocdQ8VIM5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MyocdQ8VIM5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MyocdQ8VIM5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MyocdQ8VIM5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MyocdQ8VIM5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MyocdQ8VIM5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MyocdQ8VIM5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MyocdQ8VIM5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MyocdQ8VIM5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MyocdQ8VIM5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MyocdQ8VIM5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MyocdQ8VIM5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MyocdQ8VIM5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MyocdQ8VIM5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MyocdQ8VIM5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MyocdQ8VIM5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MyocdQ8VIM5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MyocdQ8VIM5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MyocdQ8VIM5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MyocdQ8VIM5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MyocdQ8VIM5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MyocdQ8VIM5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MyocdQ8VIM5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MyocdQ8VIM5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
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