Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIK1

Snrnp25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp25Q8VIK1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snrnp25Q8VIK1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snrnp25Q8VIK1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snrnp25Q8VIK1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snrnp25Q8VIK1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snrnp25Q8VIK1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snrnp25Q8VIK1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snrnp25Q8VIK1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snrnp25Q8VIK1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Snrnp25Q8VIK1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snrnp25Q8VIK1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snrnp25Q8VIK1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snrnp25Q8VIK1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snrnp25Q8VIK1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snrnp25Q8VIK1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snrnp25Q8VIK1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snrnp25Q8VIK1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snrnp25Q8VIK1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snrnp25Q8VIK1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snrnp25Q8VIK1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snrnp25Q8VIK1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snrnp25Q8VIK1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snrnp25Q8VIK1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snrnp25Q8VIK1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snrnp25Q8VIK1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snrnp25Q8VIK1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Snrnp25Q8VIK1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snrnp25Q8VIK1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snrnp25Q8VIK1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snrnp25Q8VIK1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snrnp25Q8VIK1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snrnp25Q8VIK1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snrnp25Q8VIK1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snrnp25Q8VIK1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Snrnp25Q8VIK1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snrnp25Q8VIK1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snrnp25Q8VIK1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snrnp25Q8VIK1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snrnp25Q8VIK1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snrnp25Q8VIK1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snrnp25Q8VIK1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snrnp25Q8VIK1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Snrnp25Q8VIK1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snrnp25Q8VIK1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snrnp25Q8VIK1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snrnp25Q8VIK1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snrnp25Q8VIK1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Snrnp25Q8VIK1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snrnp25Q8VIK1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snrnp25Q8VIK1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snrnp25Q8VIK1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snrnp25Q8VIK1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snrnp25Q8VIK1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snrnp25Q8VIK1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Snrnp25Q8VIK1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snrnp25Q8VIK1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snrnp25Q8VIK1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snrnp25Q8VIK1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snrnp25Q8VIK1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snrnp25Q8VIK1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrnp25Q8VIK1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrnp25Q8VIK1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrnp25Q8VIK1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrnp25Q8VIK1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrnp25Q8VIK1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrnp25Q8VIK1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrnp25Q8VIK1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrnp25Q8VIK1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrnp25Q8VIK1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snrnp25Q8VIK1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snrnp25Q8VIK1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snrnp25Q8VIK1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snrnp25Q8VIK1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snrnp25Q8VIK1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snrnp25Q8VIK1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snrnp25Q8VIK1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snrnp25Q8VIK1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snrnp25Q8VIK1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snrnp25Q8VIK1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snrnp25Q8VIK1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snrnp25Q8VIK1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Snrnp25Q8VIK1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Snrnp25Q8VIK1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snrnp25Q8VIK1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snrnp25Q8VIK1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snrnp25Q8VIK1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snrnp25Q8VIK1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snrnp25Q8VIK1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snrnp25Q8VIK1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snrnp25Q8VIK1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snrnp25Q8VIK1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Snrnp25Q8VIK1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snrnp25Q8VIK1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snrnp25Q8VIK1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms