Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHS2

Crb1, Protein crumbs homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb1Q8VHS2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Crb1Q8VHS2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Crb1Q8VHS2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Crb1Q8VHS2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Crb1Q8VHS2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Crb1Q8VHS2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Crb1Q8VHS2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Crb1Q8VHS2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Crb1Q8VHS2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Crb1Q8VHS2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Crb1Q8VHS2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Crb1Q8VHS2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Crb1Q8VHS2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Crb1Q8VHS2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Crb1Q8VHS2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Crb1Q8VHS2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Crb1Q8VHS2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Crb1Q8VHS2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Crb1Q8VHS2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Crb1Q8VHS2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Crb1Q8VHS2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Crb1Q8VHS2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Crb1Q8VHS2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Crb1Q8VHS2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Crb1Q8VHS2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Crb1Q8VHS2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Crb1Q8VHS2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Crb1Q8VHS2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Crb1Q8VHS2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Crb1Q8VHS2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Crb1Q8VHS2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Crb1Q8VHS2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Crb1Q8VHS2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Crb1Q8VHS2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Crb1Q8VHS2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Crb1Q8VHS2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Crb1Q8VHS2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Crb1Q8VHS2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Crb1Q8VHS2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Crb1Q8VHS2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Crb1Q8VHS2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Crb1Q8VHS2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Crb1Q8VHS2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Crb1Q8VHS2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Crb1Q8VHS2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Crb1Q8VHS2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Crb1Q8VHS2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Crb1Q8VHS2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Crb1Q8VHS2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Crb1Q8VHS2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Crb1Q8VHS2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Crb1Q8VHS2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Crb1Q8VHS2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Crb1Q8VHS2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Crb1Q8VHS2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Crb1Q8VHS2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Crb1Q8VHS2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Crb1Q8VHS2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Crb1Q8VHS2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Crb1Q8VHS2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Crb1Q8VHS2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Crb1Q8VHS2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Crb1Q8VHS2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Crb1Q8VHS2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Crb1Q8VHS2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Crb1Q8VHS2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Crb1Q8VHS2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Crb1Q8VHS2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Crb1Q8VHS2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Crb1Q8VHS2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Crb1Q8VHS2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Crb1Q8VHS2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Crb1Q8VHS2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Crb1Q8VHS2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Crb1Q8VHS2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Crb1Q8VHS2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Crb1Q8VHS2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Crb1Q8VHS2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Crb1Q8VHS2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Crb1Q8VHS2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Crb1Q8VHS2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Crb1Q8VHS2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Crb1Q8VHS2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Crb1Q8VHS2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Crb1Q8VHS2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Crb1Q8VHS2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Crb1Q8VHS2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Crb1Q8VHS2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Crb1Q8VHS2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Crb1Q8VHS2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Crb1Q8VHS2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Crb1Q8VHS2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Crb1Q8VHS2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Crb1Q8VHS2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Crb1Q8VHS2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Crb1Q8VHS2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Crb1Q8VHS2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Crb1Q8VHS2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Crb1Q8VHS2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Crb1Q8VHS2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms