Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ppargc1bQ8VHJ7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ppargc1bQ8VHJ7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ppargc1bQ8VHJ7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ppargc1bQ8VHJ7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ppargc1bQ8VHJ7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ppargc1bQ8VHJ7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Ppargc1bQ8VHJ7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ppargc1bQ8VHJ7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms