Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ4

Nle1, Notchless protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nle1Q8VEJ4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nle1Q8VEJ4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nle1Q8VEJ4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nle1Q8VEJ4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nle1Q8VEJ4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nle1Q8VEJ4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nle1Q8VEJ4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nle1Q8VEJ4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nle1Q8VEJ4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nle1Q8VEJ4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nle1Q8VEJ4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nle1Q8VEJ4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nle1Q8VEJ4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nle1Q8VEJ4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nle1Q8VEJ4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nle1Q8VEJ4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nle1Q8VEJ4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nle1Q8VEJ4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nle1Q8VEJ4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nle1Q8VEJ4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nle1Q8VEJ4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nle1Q8VEJ4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nle1Q8VEJ4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nle1Q8VEJ4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nle1Q8VEJ4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nle1Q8VEJ4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nle1Q8VEJ4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nle1Q8VEJ4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nle1Q8VEJ4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nle1Q8VEJ4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nle1Q8VEJ4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nle1Q8VEJ4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nle1Q8VEJ4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nle1Q8VEJ4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nle1Q8VEJ4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nle1Q8VEJ4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nle1Q8VEJ4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nle1Q8VEJ4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nle1Q8VEJ4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nle1Q8VEJ4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nle1Q8VEJ4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nle1Q8VEJ4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nle1Q8VEJ4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nle1Q8VEJ4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nle1Q8VEJ4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nle1Q8VEJ4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nle1Q8VEJ4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nle1Q8VEJ4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nle1Q8VEJ4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nle1Q8VEJ4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nle1Q8VEJ4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nle1Q8VEJ4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nle1Q8VEJ4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nle1Q8VEJ4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nle1Q8VEJ4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nle1Q8VEJ4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nle1Q8VEJ4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nle1Q8VEJ4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nle1Q8VEJ4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Nle1Q8VEJ4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nle1Q8VEJ4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nle1Q8VEJ4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nle1Q8VEJ4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nle1Q8VEJ4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nle1Q8VEJ4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nle1Q8VEJ4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nle1Q8VEJ4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nle1Q8VEJ4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nle1Q8VEJ4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nle1Q8VEJ4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nle1Q8VEJ4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nle1Q8VEJ4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nle1Q8VEJ4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nle1Q8VEJ4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nle1Q8VEJ4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nle1Q8VEJ4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nle1Q8VEJ4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nle1Q8VEJ4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nle1Q8VEJ4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nle1Q8VEJ4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nle1Q8VEJ4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nle1Q8VEJ4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nle1Q8VEJ4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nle1Q8VEJ4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nle1Q8VEJ4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nle1Q8VEJ4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nle1Q8VEJ4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nle1Q8VEJ4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nle1Q8VEJ4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nle1Q8VEJ4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nle1Q8VEJ4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nle1Q8VEJ4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nle1Q8VEJ4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nle1Q8VEJ4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nle1Q8VEJ4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nle1Q8VEJ4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nle1Q8VEJ4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nle1Q8VEJ4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nle1Q8VEJ4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nle1Q8VEJ4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms