Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Cul7Q8VE73 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Cul7Q8VE73 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Cul7Q8VE73 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cul7Q8VE73 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cul7Q8VE73 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cul7Q8VE73 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cul7Q8VE73 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cul7Q8VE73 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cul7Q8VE73 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cul7Q8VE73 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Cul7Q8VE73 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Cul7Q8VE73 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Cul7Q8VE73 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Cul7Q8VE73 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Cul7Q8VE73 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Cul7Q8VE73 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cul7Q8VE73 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cul7Q8VE73 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cul7Q8VE73 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cul7Q8VE73 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cul7Q8VE73 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Cul7Q8VE73 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cul7Q8VE73 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cul7Q8VE73 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Cul7Q8VE73 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Cul7Q8VE73 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Cul7Q8VE73 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Cul7Q8VE73 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Cul7Q8VE73 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Cul7Q8VE73 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Cul7Q8VE73 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cul7Q8VE73 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cul7Q8VE73 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cul7Q8VE73 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cul7Q8VE73 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cul7Q8VE73 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cul7Q8VE73 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cul7Q8VE73 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cul7Q8VE73 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cul7Q8VE73 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cul7Q8VE73 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cul7Q8VE73 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cul7Q8VE73 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cul7Q8VE73 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cul7Q8VE73 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Cul7Q8VE73 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cul7Q8VE73 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Cul7Q8VE73 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Cul7Q8VE73 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Cul7Q8VE73 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Cul7Q8VE73 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Cul7Q8VE73 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Cul7Q8VE73 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cul7Q8VE73 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cul7Q8VE73 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cul7Q8VE73 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cul7Q8VE73 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Cul7Q8VE73 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cul7Q8VE73 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cul7Q8VE73 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cul7Q8VE73 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cul7Q8VE73 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cul7Q8VE73 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cul7Q8VE73 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Cul7Q8VE73 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Cul7Q8VE73 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Cul7Q8VE73 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Cul7Q8VE73 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cul7Q8VE73 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cul7Q8VE73 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cul7Q8VE73 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cul7Q8VE73 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cul7Q8VE73 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cul7Q8VE73 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cul7Q8VE73 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cul7Q8VE73 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Cul7Q8VE73 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Cul7Q8VE73 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Cul7Q8VE73 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Cul7Q8VE73 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Cul7Q8VE73 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Cul7Q8VE73 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Cul7Q8VE73 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Cul7Q8VE73 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Cul7Q8VE73 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Cul7Q8VE73 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Cul7Q8VE73 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Cul7Q8VE73 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Cul7Q8VE73 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Cul7Q8VE73 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Cul7Q8VE73 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Cul7Q8VE73 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Cul7Q8VE73 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Cul7Q8VE73 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Cul7Q8VE73 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Cul7Q8VE73 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cul7Q8VE73 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cul7Q8VE73 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cul7Q8VE73 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.8 ms