Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4R6

Nup35, Nucleoporin NUP53, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup35Q8R4R6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nup35Q8R4R6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nup35Q8R4R6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nup35Q8R4R6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nup35Q8R4R6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nup35Q8R4R6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nup35Q8R4R6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nup35Q8R4R6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nup35Q8R4R6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nup35Q8R4R6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nup35Q8R4R6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nup35Q8R4R6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nup35Q8R4R6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nup35Q8R4R6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nup35Q8R4R6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nup35Q8R4R6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nup35Q8R4R6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nup35Q8R4R6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup35Q8R4R6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup35Q8R4R6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup35Q8R4R6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup35Q8R4R6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup35Q8R4R6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup35Q8R4R6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup35Q8R4R6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup35Q8R4R6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup35Q8R4R6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup35Q8R4R6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup35Q8R4R6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup35Q8R4R6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup35Q8R4R6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup35Q8R4R6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup35Q8R4R6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup35Q8R4R6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup35Q8R4R6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup35Q8R4R6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup35Q8R4R6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nup35Q8R4R6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nup35Q8R4R6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nup35Q8R4R6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nup35Q8R4R6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup35Q8R4R6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms