Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D5

Trpm8, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm8Q8R4D5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm8Q8R4D5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm8Q8R4D5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trpm8Q8R4D5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trpm8Q8R4D5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpm8Q8R4D5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Trpm8Q8R4D5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trpm8Q8R4D5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trpm8Q8R4D5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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