Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim29Q8R2Q0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Trim29Q8R2Q0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trim29Q8R2Q0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim29Q8R2Q0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim29Q8R2Q0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim29Q8R2Q0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim29Q8R2Q0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim29Q8R2Q0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim29Q8R2Q0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim29Q8R2Q0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim29Q8R2Q0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim29Q8R2Q0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim29Q8R2Q0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim29Q8R2Q0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim29Q8R2Q0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim29Q8R2Q0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim29Q8R2Q0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim29Q8R2Q0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim29Q8R2Q0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim29Q8R2Q0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim29Q8R2Q0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim29Q8R2Q0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim29Q8R2Q0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim29Q8R2Q0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim29Q8R2Q0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim29Q8R2Q0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim29Q8R2Q0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim29Q8R2Q0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim29Q8R2Q0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim29Q8R2Q0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim29Q8R2Q0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim29Q8R2Q0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim29Q8R2Q0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim29Q8R2Q0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim29Q8R2Q0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim29Q8R2Q0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim29Q8R2Q0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim29Q8R2Q0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim29Q8R2Q0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim29Q8R2Q0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim29Q8R2Q0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim29Q8R2Q0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim29Q8R2Q0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim29Q8R2Q0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim29Q8R2Q0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim29Q8R2Q0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim29Q8R2Q0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim29Q8R2Q0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim29Q8R2Q0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim29Q8R2Q0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim29Q8R2Q0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim29Q8R2Q0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim29Q8R2Q0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim29Q8R2Q0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim29Q8R2Q0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim29Q8R2Q0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim29Q8R2Q0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim29Q8R2Q0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim29Q8R2Q0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim29Q8R2Q0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim29Q8R2Q0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim29Q8R2Q0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim29Q8R2Q0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim29Q8R2Q0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim29Q8R2Q0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim29Q8R2Q0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim29Q8R2Q0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim29Q8R2Q0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim29Q8R2Q0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim29Q8R2Q0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim29Q8R2Q0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim29Q8R2Q0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim29Q8R2Q0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim29Q8R2Q0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim29Q8R2Q0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim29Q8R2Q0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim29Q8R2Q0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim29Q8R2Q0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim29Q8R2Q0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim29Q8R2Q0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim29Q8R2Q0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim29Q8R2Q0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim29Q8R2Q0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim29Q8R2Q0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim29Q8R2Q0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim29Q8R2Q0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim29Q8R2Q0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim29Q8R2Q0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms