Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc12Q8K5B8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.4 ms