Protein–RNA interactions for Protein: Q8K448

Abca5, ATP-binding cassette sub-family A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca5Q8K448 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Abca5Q8K448 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Abca5Q8K448 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Abca5Q8K448 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Abca5Q8K448 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Abca5Q8K448 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Abca5Q8K448 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Abca5Q8K448 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Abca5Q8K448 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Abca5Q8K448 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Abca5Q8K448 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Abca5Q8K448 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Abca5Q8K448 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Abca5Q8K448 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Abca5Q8K448 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Abca5Q8K448 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Abca5Q8K448 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Abca5Q8K448 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Abca5Q8K448 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Abca5Q8K448 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Abca5Q8K448 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Abca5Q8K448 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Abca5Q8K448 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Abca5Q8K448 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Abca5Q8K448 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Abca5Q8K448 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Abca5Q8K448 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Abca5Q8K448 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Abca5Q8K448 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Abca5Q8K448 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Abca5Q8K448 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Abca5Q8K448 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Abca5Q8K448 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Abca5Q8K448 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Abca5Q8K448 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Abca5Q8K448 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Abca5Q8K448 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Abca5Q8K448 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Abca5Q8K448 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Abca5Q8K448 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Abca5Q8K448 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Abca5Q8K448 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Abca5Q8K448 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Abca5Q8K448 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Abca5Q8K448 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Abca5Q8K448 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Abca5Q8K448 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Abca5Q8K448 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Abca5Q8K448 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Abca5Q8K448 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Abca5Q8K448 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Abca5Q8K448 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Abca5Q8K448 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Abca5Q8K448 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Abca5Q8K448 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Abca5Q8K448 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Abca5Q8K448 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Abca5Q8K448 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Abca5Q8K448 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Abca5Q8K448 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Abca5Q8K448 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Abca5Q8K448 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Abca5Q8K448 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Abca5Q8K448 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Abca5Q8K448 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Abca5Q8K448 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Abca5Q8K448 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Abca5Q8K448 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Abca5Q8K448 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Abca5Q8K448 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Abca5Q8K448 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Abca5Q8K448 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Abca5Q8K448 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Abca5Q8K448 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Abca5Q8K448 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Abca5Q8K448 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Abca5Q8K448 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Abca5Q8K448 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Abca5Q8K448 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Abca5Q8K448 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Abca5Q8K448 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Abca5Q8K448 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Abca5Q8K448 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Abca5Q8K448 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Abca5Q8K448 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Abca5Q8K448 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Abca5Q8K448 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Abca5Q8K448 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Abca5Q8K448 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Abca5Q8K448 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Abca5Q8K448 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Abca5Q8K448 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Abca5Q8K448 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Abca5Q8K448 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Abca5Q8K448 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Abca5Q8K448 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Abca5Q8K448 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Abca5Q8K448 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Abca5Q8K448 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Abca5Q8K448 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.2 ms