Protein–RNA interactions for Protein: Q8K349

Gimap6, GTPase IMAP family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gimap6Q8K349 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gimap6Q8K349 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gimap6Q8K349 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gimap6Q8K349 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gimap6Q8K349 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gimap6Q8K349 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Gimap6Q8K349 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Gimap6Q8K349 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gimap6Q8K349 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gimap6Q8K349 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gimap6Q8K349 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gimap6Q8K349 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gimap6Q8K349 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gimap6Q8K349 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gimap6Q8K349 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gimap6Q8K349 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gimap6Q8K349 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gimap6Q8K349 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gimap6Q8K349 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gimap6Q8K349 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gimap6Q8K349 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gimap6Q8K349 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gimap6Q8K349 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gimap6Q8K349 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gimap6Q8K349 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Gimap6Q8K349 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Gimap6Q8K349 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gimap6Q8K349 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gimap6Q8K349 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gimap6Q8K349 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gimap6Q8K349 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gimap6Q8K349 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gimap6Q8K349 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gimap6Q8K349 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gimap6Q8K349 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gimap6Q8K349 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Gimap6Q8K349 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Gimap6Q8K349 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gimap6Q8K349 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gimap6Q8K349 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gimap6Q8K349 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gimap6Q8K349 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gimap6Q8K349 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gimap6Q8K349 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gimap6Q8K349 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gimap6Q8K349 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gimap6Q8K349 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gimap6Q8K349 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gimap6Q8K349 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gimap6Q8K349 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gimap6Q8K349 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gimap6Q8K349 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gimap6Q8K349 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gimap6Q8K349 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gimap6Q8K349 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gimap6Q8K349 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gimap6Q8K349 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gimap6Q8K349 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gimap6Q8K349 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gimap6Q8K349 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gimap6Q8K349 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gimap6Q8K349 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gimap6Q8K349 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Gimap6Q8K349 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gimap6Q8K349 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gimap6Q8K349 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gimap6Q8K349 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gimap6Q8K349 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gimap6Q8K349 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gimap6Q8K349 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gimap6Q8K349 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gimap6Q8K349 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gimap6Q8K349 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gimap6Q8K349 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gimap6Q8K349 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gimap6Q8K349 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gimap6Q8K349 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gimap6Q8K349 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gimap6Q8K349 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gimap6Q8K349 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gimap6Q8K349 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Gimap6Q8K349 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Gimap6Q8K349 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gimap6Q8K349 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gimap6Q8K349 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gimap6Q8K349 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gimap6Q8K349 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gimap6Q8K349 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gimap6Q8K349 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gimap6Q8K349 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gimap6Q8K349 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gimap6Q8K349 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gimap6Q8K349 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gimap6Q8K349 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gimap6Q8K349 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gimap6Q8K349 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Gimap6Q8K349 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Gimap6Q8K349 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gimap6Q8K349 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gimap6Q8K349 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms