Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ncapd2Q8K2Z4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ncapd2Q8K2Z4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ncapd2Q8K2Z4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ncapd2Q8K2Z4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Ncapd2Q8K2Z4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ncapd2Q8K2Z4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ncapd2Q8K2Z4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ncapd2Q8K2Z4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ncapd2Q8K2Z4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ncapd2Q8K2Z4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ncapd2Q8K2Z4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ncapd2Q8K2Z4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ncapd2Q8K2Z4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ncapd2Q8K2Z4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ncapd2Q8K2Z4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ncapd2Q8K2Z4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ncapd2Q8K2Z4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ncapd2Q8K2Z4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ncapd2Q8K2Z4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ncapd2Q8K2Z4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Ncapd2Q8K2Z4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Ncapd2Q8K2Z4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ncapd2Q8K2Z4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Ncapd2Q8K2Z4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Ncapd2Q8K2Z4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ncapd2Q8K2Z4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ncapd2Q8K2Z4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ncapd2Q8K2Z4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ncapd2Q8K2Z4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ncapd2Q8K2Z4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ncapd2Q8K2Z4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ncapd2Q8K2Z4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ncapd2Q8K2Z4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ncapd2Q8K2Z4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ncapd2Q8K2Z4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Ncapd2Q8K2Z4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ncapd2Q8K2Z4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ncapd2Q8K2Z4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ncapd2Q8K2Z4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ncapd2Q8K2Z4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ncapd2Q8K2Z4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Ncapd2Q8K2Z4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Ncapd2Q8K2Z4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ncapd2Q8K2Z4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ncapd2Q8K2Z4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ncapd2Q8K2Z4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ncapd2Q8K2Z4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ncapd2Q8K2Z4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ncapd2Q8K2Z4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ncapd2Q8K2Z4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ncapd2Q8K2Z4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ncapd2Q8K2Z4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ncapd2Q8K2Z4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ncapd2Q8K2Z4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Ncapd2Q8K2Z4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ncapd2Q8K2Z4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Ncapd2Q8K2Z4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ncapd2Q8K2Z4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ncapd2Q8K2Z4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ncapd2Q8K2Z4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ncapd2Q8K2Z4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ncapd2Q8K2Z4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ncapd2Q8K2Z4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ncapd2Q8K2Z4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ncapd2Q8K2Z4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ncapd2Q8K2Z4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ncapd2Q8K2Z4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ncapd2Q8K2Z4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ncapd2Q8K2Z4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ncapd2Q8K2Z4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ncapd2Q8K2Z4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ncapd2Q8K2Z4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ncapd2Q8K2Z4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ncapd2Q8K2Z4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ncapd2Q8K2Z4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ncapd2Q8K2Z4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ncapd2Q8K2Z4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Ncapd2Q8K2Z4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ncapd2Q8K2Z4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ncapd2Q8K2Z4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ncapd2Q8K2Z4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ncapd2Q8K2Z4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ncapd2Q8K2Z4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ncapd2Q8K2Z4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ncapd2Q8K2Z4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ncapd2Q8K2Z4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ncapd2Q8K2Z4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ncapd2Q8K2Z4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ncapd2Q8K2Z4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ncapd2Q8K2Z4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ncapd2Q8K2Z4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ncapd2Q8K2Z4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ncapd2Q8K2Z4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ncapd2Q8K2Z4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms