Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trappc12Q8K2L8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trappc12Q8K2L8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Trappc12Q8K2L8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trappc12Q8K2L8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trappc12Q8K2L8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trappc12Q8K2L8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trappc12Q8K2L8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trappc12Q8K2L8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trappc12Q8K2L8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trappc12Q8K2L8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trappc12Q8K2L8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trappc12Q8K2L8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trappc12Q8K2L8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trappc12Q8K2L8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trappc12Q8K2L8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Trappc12Q8K2L8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trappc12Q8K2L8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trappc12Q8K2L8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trappc12Q8K2L8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trappc12Q8K2L8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Trappc12Q8K2L8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trappc12Q8K2L8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Trappc12Q8K2L8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trappc12Q8K2L8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trappc12Q8K2L8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trappc12Q8K2L8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trappc12Q8K2L8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc12Q8K2L8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc12Q8K2L8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc12Q8K2L8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc12Q8K2L8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc12Q8K2L8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc12Q8K2L8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc12Q8K2L8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc12Q8K2L8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc12Q8K2L8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc12Q8K2L8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc12Q8K2L8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trappc12Q8K2L8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trappc12Q8K2L8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trappc12Q8K2L8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trappc12Q8K2L8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trappc12Q8K2L8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trappc12Q8K2L8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trappc12Q8K2L8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trappc12Q8K2L8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trappc12Q8K2L8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trappc12Q8K2L8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trappc12Q8K2L8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trappc12Q8K2L8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trappc12Q8K2L8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trappc12Q8K2L8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trappc12Q8K2L8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trappc12Q8K2L8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trappc12Q8K2L8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trappc12Q8K2L8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trappc12Q8K2L8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trappc12Q8K2L8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trappc12Q8K2L8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trappc12Q8K2L8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Trappc12Q8K2L8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trappc12Q8K2L8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trappc12Q8K2L8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trappc12Q8K2L8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trappc12Q8K2L8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trappc12Q8K2L8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trappc12Q8K2L8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Trappc12Q8K2L8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trappc12Q8K2L8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trappc12Q8K2L8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trappc12Q8K2L8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trappc12Q8K2L8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trappc12Q8K2L8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trappc12Q8K2L8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trappc12Q8K2L8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trappc12Q8K2L8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trappc12Q8K2L8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trappc12Q8K2L8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trappc12Q8K2L8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trappc12Q8K2L8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trappc12Q8K2L8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trappc12Q8K2L8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trappc12Q8K2L8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Trappc12Q8K2L8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trappc12Q8K2L8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trappc12Q8K2L8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trappc12Q8K2L8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc12Q8K2L8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc12Q8K2L8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc12Q8K2L8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc12Q8K2L8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc12Q8K2L8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc12Q8K2L8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc12Q8K2L8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc12Q8K2L8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc12Q8K2L8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc12Q8K2L8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trappc12Q8K2L8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trappc12Q8K2L8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms