Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZK6

Trim61, MCG22896, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim61Q8JZK6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim61Q8JZK6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim61Q8JZK6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim61Q8JZK6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim61Q8JZK6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim61Q8JZK6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim61Q8JZK6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim61Q8JZK6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim61Q8JZK6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim61Q8JZK6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim61Q8JZK6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim61Q8JZK6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim61Q8JZK6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim61Q8JZK6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim61Q8JZK6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim61Q8JZK6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim61Q8JZK6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim61Q8JZK6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim61Q8JZK6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim61Q8JZK6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim61Q8JZK6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim61Q8JZK6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim61Q8JZK6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim61Q8JZK6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim61Q8JZK6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim61Q8JZK6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim61Q8JZK6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim61Q8JZK6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim61Q8JZK6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim61Q8JZK6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim61Q8JZK6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim61Q8JZK6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trim61Q8JZK6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim61Q8JZK6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim61Q8JZK6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim61Q8JZK6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim61Q8JZK6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim61Q8JZK6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim61Q8JZK6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim61Q8JZK6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim61Q8JZK6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim61Q8JZK6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim61Q8JZK6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim61Q8JZK6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim61Q8JZK6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim61Q8JZK6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim61Q8JZK6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim61Q8JZK6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim61Q8JZK6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim61Q8JZK6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim61Q8JZK6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim61Q8JZK6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim61Q8JZK6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim61Q8JZK6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim61Q8JZK6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim61Q8JZK6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim61Q8JZK6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim61Q8JZK6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim61Q8JZK6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim61Q8JZK6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim61Q8JZK6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim61Q8JZK6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim61Q8JZK6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim61Q8JZK6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim61Q8JZK6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim61Q8JZK6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim61Q8JZK6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim61Q8JZK6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim61Q8JZK6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim61Q8JZK6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim61Q8JZK6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim61Q8JZK6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim61Q8JZK6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim61Q8JZK6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim61Q8JZK6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim61Q8JZK6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim61Q8JZK6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim61Q8JZK6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim61Q8JZK6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim61Q8JZK6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim61Q8JZK6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim61Q8JZK6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim61Q8JZK6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim61Q8JZK6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim61Q8JZK6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim61Q8JZK6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim61Q8JZK6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim61Q8JZK6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim61Q8JZK6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim61Q8JZK6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim61Q8JZK6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim61Q8JZK6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim61Q8JZK6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim61Q8JZK6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim61Q8JZK6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim61Q8JZK6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim61Q8JZK6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim61Q8JZK6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim61Q8JZK6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim61Q8JZK6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms