Protein–RNA interactions for Protein: Q8HWB2

H2-Q4, Histocompatibility 2, Q region locus 4, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q4Q8HWB2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2-Q4Q8HWB2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2-Q4Q8HWB2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2-Q4Q8HWB2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
H2-Q4Q8HWB2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2-Q4Q8HWB2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
H2-Q4Q8HWB2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2-Q4Q8HWB2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2-Q4Q8HWB2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2-Q4Q8HWB2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2-Q4Q8HWB2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2-Q4Q8HWB2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2-Q4Q8HWB2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2-Q4Q8HWB2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2-Q4Q8HWB2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2-Q4Q8HWB2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2-Q4Q8HWB2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2-Q4Q8HWB2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2-Q4Q8HWB2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2-Q4Q8HWB2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
H2-Q4Q8HWB2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2-Q4Q8HWB2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2-Q4Q8HWB2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
H2-Q4Q8HWB2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2-Q4Q8HWB2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2-Q4Q8HWB2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2-Q4Q8HWB2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2-Q4Q8HWB2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2-Q4Q8HWB2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2-Q4Q8HWB2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2-Q4Q8HWB2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2-Q4Q8HWB2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2-Q4Q8HWB2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2-Q4Q8HWB2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2-Q4Q8HWB2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2-Q4Q8HWB2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2-Q4Q8HWB2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2-Q4Q8HWB2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2-Q4Q8HWB2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
H2-Q4Q8HWB2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2-Q4Q8HWB2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2-Q4Q8HWB2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2-Q4Q8HWB2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2-Q4Q8HWB2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2-Q4Q8HWB2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
H2-Q4Q8HWB2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2-Q4Q8HWB2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2-Q4Q8HWB2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2-Q4Q8HWB2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
H2-Q4Q8HWB2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2-Q4Q8HWB2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
H2-Q4Q8HWB2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H2-Q4Q8HWB2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H2-Q4Q8HWB2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H2-Q4Q8HWB2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2-Q4Q8HWB2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2-Q4Q8HWB2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2-Q4Q8HWB2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2-Q4Q8HWB2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2-Q4Q8HWB2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2-Q4Q8HWB2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2-Q4Q8HWB2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2-Q4Q8HWB2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H2-Q4Q8HWB2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H2-Q4Q8HWB2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H2-Q4Q8HWB2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
H2-Q4Q8HWB2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
H2-Q4Q8HWB2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2-Q4Q8HWB2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2-Q4Q8HWB2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2-Q4Q8HWB2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H2-Q4Q8HWB2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H2-Q4Q8HWB2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H2-Q4Q8HWB2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H2-Q4Q8HWB2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H2-Q4Q8HWB2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2-Q4Q8HWB2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2-Q4Q8HWB2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2-Q4Q8HWB2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2-Q4Q8HWB2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2-Q4Q8HWB2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2-Q4Q8HWB2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2-Q4Q8HWB2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2-Q4Q8HWB2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H2-Q4Q8HWB2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H2-Q4Q8HWB2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
H2-Q4Q8HWB2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
H2-Q4Q8HWB2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
H2-Q4Q8HWB2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H2-Q4Q8HWB2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
H2-Q4Q8HWB2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2-Q4Q8HWB2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2-Q4Q8HWB2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2-Q4Q8HWB2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
H2-Q4Q8HWB2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2-Q4Q8HWB2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2-Q4Q8HWB2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
H2-Q4Q8HWB2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2-Q4Q8HWB2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2-Q4Q8HWB2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms