Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf628Q8CJ78 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf628Q8CJ78 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf628Q8CJ78 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Znf628Q8CJ78 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf628Q8CJ78 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Znf628Q8CJ78 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Znf628Q8CJ78 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf628Q8CJ78 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf628Q8CJ78 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf628Q8CJ78 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf628Q8CJ78 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf628Q8CJ78 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf628Q8CJ78 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf628Q8CJ78 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf628Q8CJ78 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf628Q8CJ78 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf628Q8CJ78 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf628Q8CJ78 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf628Q8CJ78 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf628Q8CJ78 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf628Q8CJ78 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf628Q8CJ78 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf628Q8CJ78 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf628Q8CJ78 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf628Q8CJ78 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf628Q8CJ78 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf628Q8CJ78 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf628Q8CJ78 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf628Q8CJ78 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf628Q8CJ78 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf628Q8CJ78 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf628Q8CJ78 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf628Q8CJ78 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf628Q8CJ78 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf628Q8CJ78 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf628Q8CJ78 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf628Q8CJ78 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf628Q8CJ78 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf628Q8CJ78 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf628Q8CJ78 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf628Q8CJ78 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf628Q8CJ78 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf628Q8CJ78 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf628Q8CJ78 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf628Q8CJ78 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf628Q8CJ78 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf628Q8CJ78 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf628Q8CJ78 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Znf628Q8CJ78 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms