Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHX7

Rftn2, Raftlin-2, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn2Q8CHX7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rftn2Q8CHX7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rftn2Q8CHX7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rftn2Q8CHX7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rftn2Q8CHX7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rftn2Q8CHX7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rftn2Q8CHX7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rftn2Q8CHX7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rftn2Q8CHX7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rftn2Q8CHX7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rftn2Q8CHX7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rftn2Q8CHX7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rftn2Q8CHX7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rftn2Q8CHX7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rftn2Q8CHX7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rftn2Q8CHX7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rftn2Q8CHX7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rftn2Q8CHX7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rftn2Q8CHX7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rftn2Q8CHX7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rftn2Q8CHX7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rftn2Q8CHX7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rftn2Q8CHX7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rftn2Q8CHX7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rftn2Q8CHX7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rftn2Q8CHX7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rftn2Q8CHX7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rftn2Q8CHX7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rftn2Q8CHX7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rftn2Q8CHX7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rftn2Q8CHX7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rftn2Q8CHX7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rftn2Q8CHX7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rftn2Q8CHX7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rftn2Q8CHX7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rftn2Q8CHX7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rftn2Q8CHX7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rftn2Q8CHX7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rftn2Q8CHX7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rftn2Q8CHX7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Rftn2Q8CHX7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rftn2Q8CHX7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rftn2Q8CHX7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rftn2Q8CHX7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rftn2Q8CHX7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rftn2Q8CHX7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rftn2Q8CHX7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rftn2Q8CHX7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rftn2Q8CHX7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rftn2Q8CHX7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rftn2Q8CHX7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rftn2Q8CHX7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rftn2Q8CHX7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rftn2Q8CHX7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rftn2Q8CHX7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rftn2Q8CHX7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms