Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Upp2Q8CGR7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Upp2Q8CGR7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Upp2Q8CGR7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Upp2Q8CGR7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Upp2Q8CGR7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Upp2Q8CGR7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Upp2Q8CGR7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Upp2Q8CGR7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Upp2Q8CGR7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Upp2Q8CGR7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Upp2Q8CGR7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Upp2Q8CGR7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Upp2Q8CGR7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Upp2Q8CGR7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Upp2Q8CGR7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Upp2Q8CGR7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Upp2Q8CGR7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Upp2Q8CGR7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Upp2Q8CGR7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Upp2Q8CGR7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Upp2Q8CGR7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Upp2Q8CGR7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Upp2Q8CGR7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Upp2Q8CGR7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Upp2Q8CGR7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Upp2Q8CGR7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Upp2Q8CGR7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Upp2Q8CGR7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Upp2Q8CGR7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Upp2Q8CGR7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Upp2Q8CGR7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Upp2Q8CGR7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Upp2Q8CGR7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Upp2Q8CGR7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Upp2Q8CGR7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Upp2Q8CGR7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Upp2Q8CGR7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Upp2Q8CGR7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Upp2Q8CGR7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Upp2Q8CGR7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Upp2Q8CGR7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Upp2Q8CGR7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Upp2Q8CGR7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Upp2Q8CGR7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Upp2Q8CGR7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms