Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI7

Polr2b, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2bQ8CFI7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr2bQ8CFI7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr2bQ8CFI7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr2bQ8CFI7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr2bQ8CFI7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr2bQ8CFI7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr2bQ8CFI7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr2bQ8CFI7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr2bQ8CFI7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr2bQ8CFI7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr2bQ8CFI7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr2bQ8CFI7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr2bQ8CFI7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr2bQ8CFI7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr2bQ8CFI7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr2bQ8CFI7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr2bQ8CFI7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr2bQ8CFI7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr2bQ8CFI7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr2bQ8CFI7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr2bQ8CFI7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr2bQ8CFI7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr2bQ8CFI7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr2bQ8CFI7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr2bQ8CFI7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr2bQ8CFI7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr2bQ8CFI7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr2bQ8CFI7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2bQ8CFI7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2bQ8CFI7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2bQ8CFI7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2bQ8CFI7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2bQ8CFI7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2bQ8CFI7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2bQ8CFI7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2bQ8CFI7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2bQ8CFI7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2bQ8CFI7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr2bQ8CFI7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr2bQ8CFI7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr2bQ8CFI7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr2bQ8CFI7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr2bQ8CFI7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr2bQ8CFI7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr2bQ8CFI7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr2bQ8CFI7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr2bQ8CFI7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr2bQ8CFI7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr2bQ8CFI7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr2bQ8CFI7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2bQ8CFI7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2bQ8CFI7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2bQ8CFI7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms