Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc38Q8CDN8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc38Q8CDN8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc38Q8CDN8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc38Q8CDN8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc38Q8CDN8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc38Q8CDN8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc38Q8CDN8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc38Q8CDN8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc38Q8CDN8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc38Q8CDN8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc38Q8CDN8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc38Q8CDN8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc38Q8CDN8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc38Q8CDN8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc38Q8CDN8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc38Q8CDN8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc38Q8CDN8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc38Q8CDN8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc38Q8CDN8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc38Q8CDN8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc38Q8CDN8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc38Q8CDN8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc38Q8CDN8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc38Q8CDN8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc38Q8CDN8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc38Q8CDN8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc38Q8CDN8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc38Q8CDN8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc38Q8CDN8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc38Q8CDN8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc38Q8CDN8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc38Q8CDN8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc38Q8CDN8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc38Q8CDN8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc38Q8CDN8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc38Q8CDN8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc38Q8CDN8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc38Q8CDN8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc38Q8CDN8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc38Q8CDN8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc38Q8CDN8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc38Q8CDN8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc38Q8CDN8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc38Q8CDN8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc38Q8CDN8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc38Q8CDN8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc38Q8CDN8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc38Q8CDN8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc38Q8CDN8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc38Q8CDN8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc38Q8CDN8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc38Q8CDN8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc38Q8CDN8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc38Q8CDN8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc38Q8CDN8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc38Q8CDN8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc38Q8CDN8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc38Q8CDN8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc38Q8CDN8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc38Q8CDN8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc38Q8CDN8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc38Q8CDN8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc38Q8CDN8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc38Q8CDN8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc38Q8CDN8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc38Q8CDN8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc38Q8CDN8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc38Q8CDN8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc38Q8CDN8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc38Q8CDN8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc38Q8CDN8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc38Q8CDN8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc38Q8CDN8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc38Q8CDN8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc38Q8CDN8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc38Q8CDN8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc38Q8CDN8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc38Q8CDN8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc38Q8CDN8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc38Q8CDN8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc38Q8CDN8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc38Q8CDN8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc38Q8CDN8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc38Q8CDN8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc38Q8CDN8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc38Q8CDN8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc38Q8CDN8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc38Q8CDN8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc38Q8CDN8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc38Q8CDN8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc38Q8CDN8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc38Q8CDN8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc38Q8CDN8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc38Q8CDN8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc38Q8CDN8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc38Q8CDN8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc38Q8CDN8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc38Q8CDN8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.7 ms