Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN1

Uncharacterized protein C3orf20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CDN1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8CDN1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8CDN1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8CDN1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8CDN1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8CDN1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8CDN1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8CDN1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q8CDN1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q8CDN1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q8CDN1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Q8CDN1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q8CDN1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q8CDN1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q8CDN1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q8CDN1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q8CDN1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q8CDN1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8CDN1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8CDN1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8CDN1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8CDN1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8CDN1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8CDN1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8CDN1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8CDN1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8CDN1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8CDN1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8CDN1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8CDN1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8CDN1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8CDN1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8CDN1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8CDN1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8CDN1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8CDN1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8CDN1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8CDN1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8CDN1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8CDN1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8CDN1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8CDN1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8CDN1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8CDN1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8CDN1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8CDN1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8CDN1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8CDN1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8CDN1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8CDN1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8CDN1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8CDN1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8CDN1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8CDN1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8CDN1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8CDN1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8CDN1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8CDN1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8CDN1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8CDN1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8CDN1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8CDN1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8CDN1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Q8CDN1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Q8CDN1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8CDN1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Q8CDN1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8CDN1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8CDN1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8CDN1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8CDN1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8CDN1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8CDN1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8CDN1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8CDN1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8CDN1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8CDN1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8CDN1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8CDN1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8CDN1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8CDN1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8CDN1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8CDN1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8CDN1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8CDN1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8CDN1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8CDN1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8CDN1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8CDN1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8CDN1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8CDN1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Q8CDN1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Q8CDN1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8CDN1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8CDN1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8CDN1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8CDN1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8CDN1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8CDN1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8CDN1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms