Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc73Q8CDM4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc73Q8CDM4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc73Q8CDM4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc73Q8CDM4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc73Q8CDM4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc73Q8CDM4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc73Q8CDM4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc73Q8CDM4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc73Q8CDM4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc73Q8CDM4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc73Q8CDM4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc73Q8CDM4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc73Q8CDM4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc73Q8CDM4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc73Q8CDM4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc73Q8CDM4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc73Q8CDM4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc73Q8CDM4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc73Q8CDM4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc73Q8CDM4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc73Q8CDM4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc73Q8CDM4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc73Q8CDM4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc73Q8CDM4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc73Q8CDM4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc73Q8CDM4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc73Q8CDM4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc73Q8CDM4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc73Q8CDM4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc73Q8CDM4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc73Q8CDM4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc73Q8CDM4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc73Q8CDM4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc73Q8CDM4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc73Q8CDM4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc73Q8CDM4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc73Q8CDM4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc73Q8CDM4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc73Q8CDM4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc73Q8CDM4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc73Q8CDM4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc73Q8CDM4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc73Q8CDM4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc73Q8CDM4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc73Q8CDM4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc73Q8CDM4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc73Q8CDM4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc73Q8CDM4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc73Q8CDM4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc73Q8CDM4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc73Q8CDM4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc73Q8CDM4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc73Q8CDM4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc73Q8CDM4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc73Q8CDM4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc73Q8CDM4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc73Q8CDM4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc73Q8CDM4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc73Q8CDM4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc73Q8CDM4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc73Q8CDM4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc73Q8CDM4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc73Q8CDM4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc73Q8CDM4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc73Q8CDM4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc73Q8CDM4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc73Q8CDM4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc73Q8CDM4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc73Q8CDM4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc73Q8CDM4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc73Q8CDM4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc73Q8CDM4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc73Q8CDM4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc73Q8CDM4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc73Q8CDM4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc73Q8CDM4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc73Q8CDM4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc73Q8CDM4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc73Q8CDM4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc73Q8CDM4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc73Q8CDM4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc73Q8CDM4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc73Q8CDM4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc73Q8CDM4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc73Q8CDM4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc73Q8CDM4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc73Q8CDM4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc73Q8CDM4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc73Q8CDM4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc73Q8CDM4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc73Q8CDM4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc73Q8CDM4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc73Q8CDM4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc73Q8CDM4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc73Q8CDM4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc73Q8CDM4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc73Q8CDM4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc73Q8CDM4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc73Q8CDM4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms