Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc87Q8CDL9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc87Q8CDL9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc87Q8CDL9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc87Q8CDL9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc87Q8CDL9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc87Q8CDL9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc87Q8CDL9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc87Q8CDL9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc87Q8CDL9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc87Q8CDL9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc87Q8CDL9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc87Q8CDL9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc87Q8CDL9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc87Q8CDL9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc87Q8CDL9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc87Q8CDL9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc87Q8CDL9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc87Q8CDL9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc87Q8CDL9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc87Q8CDL9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc87Q8CDL9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc87Q8CDL9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc87Q8CDL9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccdc87Q8CDL9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc87Q8CDL9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc87Q8CDL9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc87Q8CDL9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc87Q8CDL9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc87Q8CDL9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc87Q8CDL9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc87Q8CDL9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc87Q8CDL9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc87Q8CDL9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc87Q8CDL9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc87Q8CDL9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc87Q8CDL9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc87Q8CDL9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc87Q8CDL9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc87Q8CDL9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc87Q8CDL9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc87Q8CDL9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc87Q8CDL9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc87Q8CDL9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc87Q8CDL9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc87Q8CDL9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc87Q8CDL9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc87Q8CDL9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc87Q8CDL9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc87Q8CDL9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc87Q8CDL9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc87Q8CDL9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc87Q8CDL9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc87Q8CDL9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc87Q8CDL9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc87Q8CDL9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc87Q8CDL9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc87Q8CDL9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc87Q8CDL9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc87Q8CDL9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc87Q8CDL9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc87Q8CDL9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc87Q8CDL9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc87Q8CDL9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc87Q8CDL9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc87Q8CDL9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc87Q8CDL9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc87Q8CDL9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc87Q8CDL9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc87Q8CDL9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc87Q8CDL9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc87Q8CDL9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc87Q8CDL9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc87Q8CDL9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc87Q8CDL9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc87Q8CDL9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc87Q8CDL9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc87Q8CDL9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc87Q8CDL9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc87Q8CDL9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc87Q8CDL9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc87Q8CDL9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc87Q8CDL9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc87Q8CDL9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc87Q8CDL9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc87Q8CDL9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc87Q8CDL9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc87Q8CDL9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc87Q8CDL9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc87Q8CDL9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc87Q8CDL9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc87Q8CDL9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc87Q8CDL9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc87Q8CDL9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc87Q8CDL9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc87Q8CDL9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc87Q8CDL9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc87Q8CDL9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc87Q8CDL9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc87Q8CDL9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms