Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG3

Vcpip1, Deubiquitinating protein VCIP135, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcpip1Q8CDG3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vcpip1Q8CDG3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vcpip1Q8CDG3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vcpip1Q8CDG3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vcpip1Q8CDG3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vcpip1Q8CDG3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vcpip1Q8CDG3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vcpip1Q8CDG3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vcpip1Q8CDG3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vcpip1Q8CDG3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vcpip1Q8CDG3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vcpip1Q8CDG3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vcpip1Q8CDG3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vcpip1Q8CDG3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vcpip1Q8CDG3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vcpip1Q8CDG3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vcpip1Q8CDG3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vcpip1Q8CDG3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vcpip1Q8CDG3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vcpip1Q8CDG3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vcpip1Q8CDG3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vcpip1Q8CDG3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vcpip1Q8CDG3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vcpip1Q8CDG3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vcpip1Q8CDG3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vcpip1Q8CDG3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vcpip1Q8CDG3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vcpip1Q8CDG3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vcpip1Q8CDG3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vcpip1Q8CDG3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vcpip1Q8CDG3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vcpip1Q8CDG3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vcpip1Q8CDG3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vcpip1Q8CDG3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Vcpip1Q8CDG3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vcpip1Q8CDG3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vcpip1Q8CDG3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vcpip1Q8CDG3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vcpip1Q8CDG3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vcpip1Q8CDG3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vcpip1Q8CDG3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vcpip1Q8CDG3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vcpip1Q8CDG3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vcpip1Q8CDG3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vcpip1Q8CDG3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vcpip1Q8CDG3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vcpip1Q8CDG3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vcpip1Q8CDG3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vcpip1Q8CDG3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vcpip1Q8CDG3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vcpip1Q8CDG3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vcpip1Q8CDG3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vcpip1Q8CDG3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vcpip1Q8CDG3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vcpip1Q8CDG3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vcpip1Q8CDG3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vcpip1Q8CDG3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vcpip1Q8CDG3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vcpip1Q8CDG3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vcpip1Q8CDG3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vcpip1Q8CDG3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vcpip1Q8CDG3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vcpip1Q8CDG3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Vcpip1Q8CDG3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vcpip1Q8CDG3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vcpip1Q8CDG3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vcpip1Q8CDG3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vcpip1Q8CDG3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vcpip1Q8CDG3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vcpip1Q8CDG3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vcpip1Q8CDG3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Vcpip1Q8CDG3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vcpip1Q8CDG3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vcpip1Q8CDG3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vcpip1Q8CDG3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vcpip1Q8CDG3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vcpip1Q8CDG3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vcpip1Q8CDG3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vcpip1Q8CDG3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vcpip1Q8CDG3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vcpip1Q8CDG3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vcpip1Q8CDG3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vcpip1Q8CDG3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vcpip1Q8CDG3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vcpip1Q8CDG3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vcpip1Q8CDG3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Vcpip1Q8CDG3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vcpip1Q8CDG3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vcpip1Q8CDG3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vcpip1Q8CDG3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vcpip1Q8CDG3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vcpip1Q8CDG3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vcpip1Q8CDG3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vcpip1Q8CDG3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vcpip1Q8CDG3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vcpip1Q8CDG3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vcpip1Q8CDG3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Vcpip1Q8CDG3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vcpip1Q8CDG3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Vcpip1Q8CDG3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms