Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCF0

Prpf31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf31Q8CCF0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prpf31Q8CCF0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf31Q8CCF0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf31Q8CCF0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf31Q8CCF0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf31Q8CCF0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf31Q8CCF0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf31Q8CCF0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf31Q8CCF0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpf31Q8CCF0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpf31Q8CCF0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpf31Q8CCF0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpf31Q8CCF0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpf31Q8CCF0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpf31Q8CCF0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf31Q8CCF0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf31Q8CCF0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf31Q8CCF0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf31Q8CCF0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf31Q8CCF0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf31Q8CCF0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf31Q8CCF0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf31Q8CCF0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf31Q8CCF0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf31Q8CCF0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf31Q8CCF0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf31Q8CCF0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf31Q8CCF0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf31Q8CCF0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf31Q8CCF0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf31Q8CCF0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf31Q8CCF0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpf31Q8CCF0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpf31Q8CCF0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpf31Q8CCF0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpf31Q8CCF0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpf31Q8CCF0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpf31Q8CCF0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpf31Q8CCF0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpf31Q8CCF0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prpf31Q8CCF0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prpf31Q8CCF0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Prpf31Q8CCF0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prpf31Q8CCF0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prpf31Q8CCF0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prpf31Q8CCF0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prpf31Q8CCF0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prpf31Q8CCF0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Prpf31Q8CCF0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prpf31Q8CCF0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prpf31Q8CCF0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf31Q8CCF0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf31Q8CCF0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf31Q8CCF0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf31Q8CCF0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpf31Q8CCF0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpf31Q8CCF0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpf31Q8CCF0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpf31Q8CCF0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpf31Q8CCF0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpf31Q8CCF0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpf31Q8CCF0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpf31Q8CCF0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.6 ms