Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nrip1Q8CBD1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nrip1Q8CBD1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nrip1Q8CBD1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nrip1Q8CBD1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nrip1Q8CBD1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nrip1Q8CBD1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nrip1Q8CBD1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nrip1Q8CBD1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nrip1Q8CBD1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nrip1Q8CBD1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nrip1Q8CBD1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nrip1Q8CBD1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nrip1Q8CBD1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nrip1Q8CBD1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nrip1Q8CBD1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nrip1Q8CBD1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nrip1Q8CBD1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nrip1Q8CBD1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nrip1Q8CBD1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nrip1Q8CBD1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nrip1Q8CBD1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nrip1Q8CBD1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nrip1Q8CBD1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nrip1Q8CBD1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nrip1Q8CBD1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nrip1Q8CBD1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nrip1Q8CBD1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nrip1Q8CBD1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nrip1Q8CBD1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nrip1Q8CBD1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nrip1Q8CBD1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nrip1Q8CBD1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nrip1Q8CBD1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nrip1Q8CBD1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nrip1Q8CBD1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nrip1Q8CBD1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nrip1Q8CBD1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nrip1Q8CBD1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nrip1Q8CBD1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nrip1Q8CBD1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nrip1Q8CBD1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nrip1Q8CBD1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nrip1Q8CBD1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nrip1Q8CBD1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nrip1Q8CBD1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nrip1Q8CBD1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nrip1Q8CBD1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nrip1Q8CBD1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nrip1Q8CBD1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nrip1Q8CBD1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nrip1Q8CBD1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nrip1Q8CBD1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nrip1Q8CBD1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nrip1Q8CBD1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nrip1Q8CBD1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nrip1Q8CBD1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nrip1Q8CBD1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nrip1Q8CBD1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nrip1Q8CBD1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nrip1Q8CBD1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nrip1Q8CBD1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nrip1Q8CBD1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nrip1Q8CBD1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nrip1Q8CBD1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nrip1Q8CBD1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nrip1Q8CBD1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nrip1Q8CBD1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nrip1Q8CBD1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nrip1Q8CBD1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nrip1Q8CBD1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nrip1Q8CBD1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nrip1Q8CBD1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nrip1Q8CBD1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nrip1Q8CBD1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nrip1Q8CBD1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nrip1Q8CBD1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nrip1Q8CBD1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nrip1Q8CBD1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nrip1Q8CBD1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nrip1Q8CBD1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nrip1Q8CBD1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nrip1Q8CBD1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nrip1Q8CBD1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nrip1Q8CBD1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Nrip1Q8CBD1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nrip1Q8CBD1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nrip1Q8CBD1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nrip1Q8CBD1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nrip1Q8CBD1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nrip1Q8CBD1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nrip1Q8CBD1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nrip1Q8CBD1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nrip1Q8CBD1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nrip1Q8CBD1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nrip1Q8CBD1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nrip1Q8CBD1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nrip1Q8CBD1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nrip1Q8CBD1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nrip1Q8CBD1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms