Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Fbxo48Q8CAT8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fbxo48Q8CAT8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fbxo48Q8CAT8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo48Q8CAT8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo48Q8CAT8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo48Q8CAT8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo48Q8CAT8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo48Q8CAT8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo48Q8CAT8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo48Q8CAT8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo48Q8CAT8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo48Q8CAT8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fbxo48Q8CAT8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms