Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8T8

Tsr2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr2Q8C8T8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tsr2Q8C8T8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tsr2Q8C8T8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tsr2Q8C8T8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tsr2Q8C8T8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tsr2Q8C8T8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tsr2Q8C8T8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tsr2Q8C8T8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tsr2Q8C8T8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tsr2Q8C8T8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tsr2Q8C8T8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tsr2Q8C8T8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tsr2Q8C8T8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tsr2Q8C8T8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tsr2Q8C8T8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tsr2Q8C8T8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tsr2Q8C8T8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tsr2Q8C8T8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tsr2Q8C8T8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tsr2Q8C8T8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tsr2Q8C8T8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tsr2Q8C8T8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tsr2Q8C8T8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tsr2Q8C8T8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tsr2Q8C8T8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tsr2Q8C8T8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tsr2Q8C8T8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tsr2Q8C8T8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tsr2Q8C8T8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tsr2Q8C8T8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tsr2Q8C8T8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Tsr2Q8C8T8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tsr2Q8C8T8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Tsr2Q8C8T8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tsr2Q8C8T8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tsr2Q8C8T8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tsr2Q8C8T8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tsr2Q8C8T8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Tsr2Q8C8T8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tsr2Q8C8T8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tsr2Q8C8T8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tsr2Q8C8T8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tsr2Q8C8T8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tsr2Q8C8T8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tsr2Q8C8T8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tsr2Q8C8T8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tsr2Q8C8T8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tsr2Q8C8T8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tsr2Q8C8T8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tsr2Q8C8T8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tsr2Q8C8T8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tsr2Q8C8T8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tsr2Q8C8T8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tsr2Q8C8T8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tsr2Q8C8T8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tsr2Q8C8T8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tsr2Q8C8T8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tsr2Q8C8T8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tsr2Q8C8T8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tsr2Q8C8T8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tsr2Q8C8T8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tsr2Q8C8T8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tsr2Q8C8T8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tsr2Q8C8T8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tsr2Q8C8T8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tsr2Q8C8T8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tsr2Q8C8T8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tsr2Q8C8T8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tsr2Q8C8T8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tsr2Q8C8T8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tsr2Q8C8T8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tsr2Q8C8T8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tsr2Q8C8T8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tsr2Q8C8T8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tsr2Q8C8T8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tsr2Q8C8T8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tsr2Q8C8T8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tsr2Q8C8T8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tsr2Q8C8T8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tsr2Q8C8T8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tsr2Q8C8T8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tsr2Q8C8T8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Tsr2Q8C8T8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tsr2Q8C8T8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tsr2Q8C8T8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tsr2Q8C8T8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tsr2Q8C8T8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tsr2Q8C8T8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tsr2Q8C8T8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tsr2Q8C8T8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tsr2Q8C8T8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tsr2Q8C8T8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tsr2Q8C8T8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tsr2Q8C8T8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tsr2Q8C8T8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tsr2Q8C8T8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tsr2Q8C8T8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tsr2Q8C8T8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tsr2Q8C8T8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tsr2Q8C8T8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms