Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vwc2Q8C8N3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vwc2Q8C8N3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vwc2Q8C8N3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vwc2Q8C8N3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vwc2Q8C8N3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vwc2Q8C8N3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vwc2Q8C8N3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vwc2Q8C8N3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vwc2Q8C8N3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vwc2Q8C8N3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms