Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7U1

N4bp3, NEDD4-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp3Q8C7U1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
N4bp3Q8C7U1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
N4bp3Q8C7U1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
N4bp3Q8C7U1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
N4bp3Q8C7U1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
N4bp3Q8C7U1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
N4bp3Q8C7U1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
N4bp3Q8C7U1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
N4bp3Q8C7U1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
N4bp3Q8C7U1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
N4bp3Q8C7U1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
N4bp3Q8C7U1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
N4bp3Q8C7U1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
N4bp3Q8C7U1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
N4bp3Q8C7U1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
N4bp3Q8C7U1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
N4bp3Q8C7U1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
N4bp3Q8C7U1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
N4bp3Q8C7U1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
N4bp3Q8C7U1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
N4bp3Q8C7U1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
N4bp3Q8C7U1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
N4bp3Q8C7U1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
N4bp3Q8C7U1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
N4bp3Q8C7U1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
N4bp3Q8C7U1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
N4bp3Q8C7U1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
N4bp3Q8C7U1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
N4bp3Q8C7U1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
N4bp3Q8C7U1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
N4bp3Q8C7U1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
N4bp3Q8C7U1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
N4bp3Q8C7U1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
N4bp3Q8C7U1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
N4bp3Q8C7U1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
N4bp3Q8C7U1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
N4bp3Q8C7U1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
N4bp3Q8C7U1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
N4bp3Q8C7U1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
N4bp3Q8C7U1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
N4bp3Q8C7U1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
N4bp3Q8C7U1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
N4bp3Q8C7U1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
N4bp3Q8C7U1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
N4bp3Q8C7U1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
N4bp3Q8C7U1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
N4bp3Q8C7U1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
N4bp3Q8C7U1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
N4bp3Q8C7U1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
N4bp3Q8C7U1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
N4bp3Q8C7U1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
N4bp3Q8C7U1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
N4bp3Q8C7U1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
N4bp3Q8C7U1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
N4bp3Q8C7U1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
N4bp3Q8C7U1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
N4bp3Q8C7U1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
N4bp3Q8C7U1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
N4bp3Q8C7U1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
N4bp3Q8C7U1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
N4bp3Q8C7U1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
N4bp3Q8C7U1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
N4bp3Q8C7U1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
N4bp3Q8C7U1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
N4bp3Q8C7U1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
N4bp3Q8C7U1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
N4bp3Q8C7U1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
N4bp3Q8C7U1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
N4bp3Q8C7U1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
N4bp3Q8C7U1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
N4bp3Q8C7U1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
N4bp3Q8C7U1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
N4bp3Q8C7U1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
N4bp3Q8C7U1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
N4bp3Q8C7U1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
N4bp3Q8C7U1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
N4bp3Q8C7U1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
N4bp3Q8C7U1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
N4bp3Q8C7U1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
N4bp3Q8C7U1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
N4bp3Q8C7U1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
N4bp3Q8C7U1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
N4bp3Q8C7U1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
N4bp3Q8C7U1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
N4bp3Q8C7U1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
N4bp3Q8C7U1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
N4bp3Q8C7U1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
N4bp3Q8C7U1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
N4bp3Q8C7U1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
N4bp3Q8C7U1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
N4bp3Q8C7U1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
N4bp3Q8C7U1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
N4bp3Q8C7U1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
N4bp3Q8C7U1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
N4bp3Q8C7U1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
N4bp3Q8C7U1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
N4bp3Q8C7U1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
N4bp3Q8C7U1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
N4bp3Q8C7U1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
N4bp3Q8C7U1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms