Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7R7

Rfx6, DNA-binding protein RFX6, mousemouse

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Length 927 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx6Q8C7R7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rfx6Q8C7R7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rfx6Q8C7R7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rfx6Q8C7R7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rfx6Q8C7R7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rfx6Q8C7R7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfx6Q8C7R7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfx6Q8C7R7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfx6Q8C7R7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfx6Q8C7R7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfx6Q8C7R7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfx6Q8C7R7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfx6Q8C7R7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfx6Q8C7R7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfx6Q8C7R7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfx6Q8C7R7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx6Q8C7R7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx6Q8C7R7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx6Q8C7R7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx6Q8C7R7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx6Q8C7R7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx6Q8C7R7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx6Q8C7R7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfx6Q8C7R7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfx6Q8C7R7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfx6Q8C7R7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfx6Q8C7R7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfx6Q8C7R7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfx6Q8C7R7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfx6Q8C7R7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfx6Q8C7R7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfx6Q8C7R7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfx6Q8C7R7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfx6Q8C7R7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfx6Q8C7R7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfx6Q8C7R7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfx6Q8C7R7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfx6Q8C7R7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfx6Q8C7R7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfx6Q8C7R7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfx6Q8C7R7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfx6Q8C7R7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfx6Q8C7R7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfx6Q8C7R7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfx6Q8C7R7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfx6Q8C7R7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfx6Q8C7R7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfx6Q8C7R7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx6Q8C7R7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx6Q8C7R7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx6Q8C7R7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx6Q8C7R7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx6Q8C7R7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx6Q8C7R7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx6Q8C7R7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
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