Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Y0

4930572O03Rik, RIKEN cDNA 4930572O03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930572O03RikQ8C5Y0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
4930572O03RikQ8C5Y0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
4930572O03RikQ8C5Y0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
4930572O03RikQ8C5Y0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
4930572O03RikQ8C5Y0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
4930572O03RikQ8C5Y0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
4930572O03RikQ8C5Y0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
4930572O03RikQ8C5Y0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
4930572O03RikQ8C5Y0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
4930572O03RikQ8C5Y0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
4930572O03RikQ8C5Y0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
4930572O03RikQ8C5Y0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
4930572O03RikQ8C5Y0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
4930572O03RikQ8C5Y0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
4930572O03RikQ8C5Y0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
4930572O03RikQ8C5Y0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
4930572O03RikQ8C5Y0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
4930572O03RikQ8C5Y0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
4930572O03RikQ8C5Y0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
4930572O03RikQ8C5Y0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
4930572O03RikQ8C5Y0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
4930572O03RikQ8C5Y0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
4930572O03RikQ8C5Y0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
4930572O03RikQ8C5Y0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
4930572O03RikQ8C5Y0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
4930572O03RikQ8C5Y0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
4930572O03RikQ8C5Y0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
4930572O03RikQ8C5Y0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
4930572O03RikQ8C5Y0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
4930572O03RikQ8C5Y0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
4930572O03RikQ8C5Y0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
4930572O03RikQ8C5Y0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
4930572O03RikQ8C5Y0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
4930572O03RikQ8C5Y0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
4930572O03RikQ8C5Y0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
4930572O03RikQ8C5Y0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms