Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5W0

Clmn, Calmin, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmnQ8C5W0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ClmnQ8C5W0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ClmnQ8C5W0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ClmnQ8C5W0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ClmnQ8C5W0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ClmnQ8C5W0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ClmnQ8C5W0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ClmnQ8C5W0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ClmnQ8C5W0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ClmnQ8C5W0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ClmnQ8C5W0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ClmnQ8C5W0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ClmnQ8C5W0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ClmnQ8C5W0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ClmnQ8C5W0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ClmnQ8C5W0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ClmnQ8C5W0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ClmnQ8C5W0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ClmnQ8C5W0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ClmnQ8C5W0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ClmnQ8C5W0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ClmnQ8C5W0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ClmnQ8C5W0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ClmnQ8C5W0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ClmnQ8C5W0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ClmnQ8C5W0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ClmnQ8C5W0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ClmnQ8C5W0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ClmnQ8C5W0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ClmnQ8C5W0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ClmnQ8C5W0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ClmnQ8C5W0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ClmnQ8C5W0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ClmnQ8C5W0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ClmnQ8C5W0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ClmnQ8C5W0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ClmnQ8C5W0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ClmnQ8C5W0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ClmnQ8C5W0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ClmnQ8C5W0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ClmnQ8C5W0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ClmnQ8C5W0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ClmnQ8C5W0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ClmnQ8C5W0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ClmnQ8C5W0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ClmnQ8C5W0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ClmnQ8C5W0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ClmnQ8C5W0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ClmnQ8C5W0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ClmnQ8C5W0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ClmnQ8C5W0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ClmnQ8C5W0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ClmnQ8C5W0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ClmnQ8C5W0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ClmnQ8C5W0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms