Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q3

Ttc34, Tetratricopeptide repeat protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc34Q8C0Q3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc34Q8C0Q3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc34Q8C0Q3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc34Q8C0Q3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc34Q8C0Q3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc34Q8C0Q3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc34Q8C0Q3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc34Q8C0Q3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc34Q8C0Q3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc34Q8C0Q3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc34Q8C0Q3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc34Q8C0Q3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc34Q8C0Q3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc34Q8C0Q3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc34Q8C0Q3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc34Q8C0Q3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc34Q8C0Q3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc34Q8C0Q3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc34Q8C0Q3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc34Q8C0Q3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc34Q8C0Q3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc34Q8C0Q3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc34Q8C0Q3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc34Q8C0Q3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc34Q8C0Q3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc34Q8C0Q3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc34Q8C0Q3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc34Q8C0Q3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc34Q8C0Q3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc34Q8C0Q3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc34Q8C0Q3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc34Q8C0Q3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ttc34Q8C0Q3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc34Q8C0Q3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Ttc34Q8C0Q3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ttc34Q8C0Q3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ttc34Q8C0Q3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc34Q8C0Q3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc34Q8C0Q3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc34Q8C0Q3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc34Q8C0Q3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc34Q8C0Q3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc34Q8C0Q3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc34Q8C0Q3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc34Q8C0Q3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc34Q8C0Q3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc34Q8C0Q3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc34Q8C0Q3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc34Q8C0Q3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc34Q8C0Q3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc34Q8C0Q3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc34Q8C0Q3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc34Q8C0Q3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc34Q8C0Q3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc34Q8C0Q3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc34Q8C0Q3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms