Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccser1Q8C0C4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccser1Q8C0C4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccser1Q8C0C4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccser1Q8C0C4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccser1Q8C0C4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccser1Q8C0C4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccser1Q8C0C4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccser1Q8C0C4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccser1Q8C0C4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccser1Q8C0C4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccser1Q8C0C4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccser1Q8C0C4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccser1Q8C0C4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccser1Q8C0C4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccser1Q8C0C4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccser1Q8C0C4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccser1Q8C0C4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccser1Q8C0C4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccser1Q8C0C4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccser1Q8C0C4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccser1Q8C0C4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccser1Q8C0C4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccser1Q8C0C4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccser1Q8C0C4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccser1Q8C0C4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccser1Q8C0C4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccser1Q8C0C4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccser1Q8C0C4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccser1Q8C0C4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccser1Q8C0C4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccser1Q8C0C4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccser1Q8C0C4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccser1Q8C0C4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccser1Q8C0C4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccser1Q8C0C4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccser1Q8C0C4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccser1Q8C0C4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccser1Q8C0C4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccser1Q8C0C4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccser1Q8C0C4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccser1Q8C0C4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccser1Q8C0C4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccser1Q8C0C4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccser1Q8C0C4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccser1Q8C0C4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccser1Q8C0C4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccser1Q8C0C4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccser1Q8C0C4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccser1Q8C0C4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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