Protein–RNA interactions for Protein: Q8C079

Strip1, Striatin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strip1Q8C079 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Strip1Q8C079 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Strip1Q8C079 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Strip1Q8C079 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Strip1Q8C079 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Strip1Q8C079 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Strip1Q8C079 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Strip1Q8C079 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Strip1Q8C079 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Strip1Q8C079 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Strip1Q8C079 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Strip1Q8C079 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Strip1Q8C079 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Strip1Q8C079 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Strip1Q8C079 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Strip1Q8C079 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Strip1Q8C079 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Strip1Q8C079 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Strip1Q8C079 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Strip1Q8C079 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Strip1Q8C079 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Strip1Q8C079 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Strip1Q8C079 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Strip1Q8C079 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Strip1Q8C079 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Strip1Q8C079 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Strip1Q8C079 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Strip1Q8C079 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Strip1Q8C079 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Strip1Q8C079 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Strip1Q8C079 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Strip1Q8C079 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Strip1Q8C079 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Strip1Q8C079 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Strip1Q8C079 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Strip1Q8C079 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Strip1Q8C079 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Strip1Q8C079 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Strip1Q8C079 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Strip1Q8C079 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Strip1Q8C079 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Strip1Q8C079 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Strip1Q8C079 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Strip1Q8C079 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Strip1Q8C079 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Strip1Q8C079 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Strip1Q8C079 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Strip1Q8C079 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Strip1Q8C079 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Strip1Q8C079 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Strip1Q8C079 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Strip1Q8C079 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Strip1Q8C079 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Strip1Q8C079 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Strip1Q8C079 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Strip1Q8C079 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Strip1Q8C079 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Strip1Q8C079 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Strip1Q8C079 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Strip1Q8C079 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Strip1Q8C079 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Strip1Q8C079 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Strip1Q8C079 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Strip1Q8C079 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Strip1Q8C079 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Strip1Q8C079 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Strip1Q8C079 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Strip1Q8C079 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Strip1Q8C079 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Strip1Q8C079 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Strip1Q8C079 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Strip1Q8C079 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Strip1Q8C079 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Strip1Q8C079 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Strip1Q8C079 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Strip1Q8C079 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Strip1Q8C079 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Strip1Q8C079 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Strip1Q8C079 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Strip1Q8C079 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Strip1Q8C079 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Strip1Q8C079 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Strip1Q8C079 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Strip1Q8C079 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Strip1Q8C079 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Strip1Q8C079 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Strip1Q8C079 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Strip1Q8C079 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Strip1Q8C079 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Strip1Q8C079 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Strip1Q8C079 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Strip1Q8C079 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Strip1Q8C079 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Strip1Q8C079 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Strip1Q8C079 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Strip1Q8C079 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Strip1Q8C079 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Strip1Q8C079 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Strip1Q8C079 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Strip1Q8C079 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms