Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL7

Arfrp1, ADP-ribosylation factor-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfrp1Q8BXL7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfrp1Q8BXL7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfrp1Q8BXL7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfrp1Q8BXL7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfrp1Q8BXL7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfrp1Q8BXL7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfrp1Q8BXL7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfrp1Q8BXL7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfrp1Q8BXL7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfrp1Q8BXL7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfrp1Q8BXL7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfrp1Q8BXL7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfrp1Q8BXL7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfrp1Q8BXL7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arfrp1Q8BXL7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arfrp1Q8BXL7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arfrp1Q8BXL7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Arfrp1Q8BXL7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arfrp1Q8BXL7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arfrp1Q8BXL7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arfrp1Q8BXL7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfrp1Q8BXL7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfrp1Q8BXL7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfrp1Q8BXL7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfrp1Q8BXL7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfrp1Q8BXL7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfrp1Q8BXL7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfrp1Q8BXL7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfrp1Q8BXL7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfrp1Q8BXL7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfrp1Q8BXL7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfrp1Q8BXL7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfrp1Q8BXL7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfrp1Q8BXL7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfrp1Q8BXL7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfrp1Q8BXL7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfrp1Q8BXL7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfrp1Q8BXL7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfrp1Q8BXL7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfrp1Q8BXL7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfrp1Q8BXL7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfrp1Q8BXL7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfrp1Q8BXL7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfrp1Q8BXL7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfrp1Q8BXL7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfrp1Q8BXL7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfrp1Q8BXL7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms