Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn17Q8BXA6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn17Q8BXA6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn17Q8BXA6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn17Q8BXA6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn17Q8BXA6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn17Q8BXA6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn17Q8BXA6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn17Q8BXA6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cldn17Q8BXA6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn17Q8BXA6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn17Q8BXA6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn17Q8BXA6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn17Q8BXA6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn17Q8BXA6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn17Q8BXA6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn17Q8BXA6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn17Q8BXA6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn17Q8BXA6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn17Q8BXA6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn17Q8BXA6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn17Q8BXA6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn17Q8BXA6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn17Q8BXA6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn17Q8BXA6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn17Q8BXA6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn17Q8BXA6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn17Q8BXA6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn17Q8BXA6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn17Q8BXA6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn17Q8BXA6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn17Q8BXA6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn17Q8BXA6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn17Q8BXA6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn17Q8BXA6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn17Q8BXA6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn17Q8BXA6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn17Q8BXA6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn17Q8BXA6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn17Q8BXA6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn17Q8BXA6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn17Q8BXA6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn17Q8BXA6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn17Q8BXA6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Cldn17Q8BXA6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn17Q8BXA6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn17Q8BXA6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms