Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctdsp2Q8BX07 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctdsp2Q8BX07 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctdsp2Q8BX07 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctdsp2Q8BX07 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctdsp2Q8BX07 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctdsp2Q8BX07 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctdsp2Q8BX07 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctdsp2Q8BX07 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctdsp2Q8BX07 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctdsp2Q8BX07 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctdsp2Q8BX07 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctdsp2Q8BX07 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctdsp2Q8BX07 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctdsp2Q8BX07 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctdsp2Q8BX07 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctdsp2Q8BX07 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctdsp2Q8BX07 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctdsp2Q8BX07 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctdsp2Q8BX07 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctdsp2Q8BX07 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctdsp2Q8BX07 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctdsp2Q8BX07 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctdsp2Q8BX07 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctdsp2Q8BX07 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctdsp2Q8BX07 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctdsp2Q8BX07 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctdsp2Q8BX07 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctdsp2Q8BX07 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctdsp2Q8BX07 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctdsp2Q8BX07 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctdsp2Q8BX07 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctdsp2Q8BX07 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctdsp2Q8BX07 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctdsp2Q8BX07 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctdsp2Q8BX07 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctdsp2Q8BX07 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctdsp2Q8BX07 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctdsp2Q8BX07 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctdsp2Q8BX07 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctdsp2Q8BX07 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctdsp2Q8BX07 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdsp2Q8BX07 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdsp2Q8BX07 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdsp2Q8BX07 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdsp2Q8BX07 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdsp2Q8BX07 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctdsp2Q8BX07 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctdsp2Q8BX07 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctdsp2Q8BX07 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctdsp2Q8BX07 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctdsp2Q8BX07 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdsp2Q8BX07 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdsp2Q8BX07 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdsp2Q8BX07 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdsp2Q8BX07 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdsp2Q8BX07 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctdsp2Q8BX07 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctdsp2Q8BX07 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctdsp2Q8BX07 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctdsp2Q8BX07 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctdsp2Q8BX07 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctdsp2Q8BX07 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ctdsp2Q8BX07 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdsp2Q8BX07 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdsp2Q8BX07 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdsp2Q8BX07 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdsp2Q8BX07 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdsp2Q8BX07 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdsp2Q8BX07 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdsp2Q8BX07 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdsp2Q8BX07 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdsp2Q8BX07 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdsp2Q8BX07 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdsp2Q8BX07 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdsp2Q8BX07 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctdsp2Q8BX07 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctdsp2Q8BX07 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctdsp2Q8BX07 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctdsp2Q8BX07 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctdsp2Q8BX07 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctdsp2Q8BX07 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctdsp2Q8BX07 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctdsp2Q8BX07 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctdsp2Q8BX07 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctdsp2Q8BX07 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctdsp2Q8BX07 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctdsp2Q8BX07 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctdsp2Q8BX07 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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