Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm4aQ8BW72 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm4aQ8BW72 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm4aQ8BW72 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Kdm4aQ8BW72 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Kdm4aQ8BW72 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kdm4aQ8BW72 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kdm4aQ8BW72 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kdm4aQ8BW72 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm4aQ8BW72 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm4aQ8BW72 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm4aQ8BW72 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm4aQ8BW72 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm4aQ8BW72 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm4aQ8BW72 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm4aQ8BW72 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm4aQ8BW72 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm4aQ8BW72 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm4aQ8BW72 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm4aQ8BW72 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm4aQ8BW72 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm4aQ8BW72 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm4aQ8BW72 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm4aQ8BW72 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm4aQ8BW72 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm4aQ8BW72 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm4aQ8BW72 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm4aQ8BW72 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm4aQ8BW72 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm4aQ8BW72 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm4aQ8BW72 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm4aQ8BW72 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kdm4aQ8BW72 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Kdm4aQ8BW72 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kdm4aQ8BW72 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kdm4aQ8BW72 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kdm4aQ8BW72 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Kdm4aQ8BW72 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kdm4aQ8BW72 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kdm4aQ8BW72 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Kdm4aQ8BW72 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Kdm4aQ8BW72 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm4aQ8BW72 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm4aQ8BW72 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm4aQ8BW72 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm4aQ8BW72 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm4aQ8BW72 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm4aQ8BW72 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm4aQ8BW72 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm4aQ8BW72 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm4aQ8BW72 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm4aQ8BW72 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm4aQ8BW72 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm4aQ8BW72 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm4aQ8BW72 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm4aQ8BW72 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm4aQ8BW72 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm4aQ8BW72 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm4aQ8BW72 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm4aQ8BW72 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm4aQ8BW72 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm4aQ8BW72 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm4aQ8BW72 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm4aQ8BW72 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm4aQ8BW72 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm4aQ8BW72 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm4aQ8BW72 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm4aQ8BW72 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Kdm4aQ8BW72 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kdm4aQ8BW72 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kdm4aQ8BW72 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kdm4aQ8BW72 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kdm4aQ8BW72 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Kdm4aQ8BW72 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Kdm4aQ8BW72 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm4aQ8BW72 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm4aQ8BW72 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm4aQ8BW72 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm4aQ8BW72 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm4aQ8BW72 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm4aQ8BW72 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm4aQ8BW72 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm4aQ8BW72 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm4aQ8BW72 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm4aQ8BW72 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm4aQ8BW72 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm4aQ8BW72 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm4aQ8BW72 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm4aQ8BW72 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm4aQ8BW72 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm4aQ8BW72 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm4aQ8BW72 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm4aQ8BW72 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm4aQ8BW72 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm4aQ8BW72 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm4aQ8BW72 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm4aQ8BW72 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm4aQ8BW72 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm4aQ8BW72 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm4aQ8BW72 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.2 ms