Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPZ8

Abraxas1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abraxas1Q8BPZ8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abraxas1Q8BPZ8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abraxas1Q8BPZ8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abraxas1Q8BPZ8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abraxas1Q8BPZ8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abraxas1Q8BPZ8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abraxas1Q8BPZ8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abraxas1Q8BPZ8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abraxas1Q8BPZ8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abraxas1Q8BPZ8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abraxas1Q8BPZ8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abraxas1Q8BPZ8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abraxas1Q8BPZ8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abraxas1Q8BPZ8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abraxas1Q8BPZ8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abraxas1Q8BPZ8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Abraxas1Q8BPZ8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Abraxas1Q8BPZ8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Abraxas1Q8BPZ8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abraxas1Q8BPZ8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abraxas1Q8BPZ8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abraxas1Q8BPZ8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abraxas1Q8BPZ8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abraxas1Q8BPZ8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abraxas1Q8BPZ8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abraxas1Q8BPZ8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abraxas1Q8BPZ8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abraxas1Q8BPZ8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abraxas1Q8BPZ8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Abraxas1Q8BPZ8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abraxas1Q8BPZ8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abraxas1Q8BPZ8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abraxas1Q8BPZ8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abraxas1Q8BPZ8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Abraxas1Q8BPZ8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abraxas1Q8BPZ8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abraxas1Q8BPZ8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abraxas1Q8BPZ8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abraxas1Q8BPZ8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abraxas1Q8BPZ8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abraxas1Q8BPZ8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abraxas1Q8BPZ8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abraxas1Q8BPZ8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abraxas1Q8BPZ8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abraxas1Q8BPZ8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abraxas1Q8BPZ8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abraxas1Q8BPZ8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abraxas1Q8BPZ8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abraxas1Q8BPZ8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abraxas1Q8BPZ8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abraxas1Q8BPZ8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abraxas1Q8BPZ8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abraxas1Q8BPZ8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abraxas1Q8BPZ8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abraxas1Q8BPZ8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abraxas1Q8BPZ8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abraxas1Q8BPZ8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abraxas1Q8BPZ8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abraxas1Q8BPZ8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abraxas1Q8BPZ8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abraxas1Q8BPZ8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Abraxas1Q8BPZ8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Abraxas1Q8BPZ8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Abraxas1Q8BPZ8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abraxas1Q8BPZ8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abraxas1Q8BPZ8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Abraxas1Q8BPZ8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abraxas1Q8BPZ8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abraxas1Q8BPZ8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abraxas1Q8BPZ8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abraxas1Q8BPZ8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abraxas1Q8BPZ8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Abraxas1Q8BPZ8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abraxas1Q8BPZ8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abraxas1Q8BPZ8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abraxas1Q8BPZ8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abraxas1Q8BPZ8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abraxas1Q8BPZ8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abraxas1Q8BPZ8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abraxas1Q8BPZ8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abraxas1Q8BPZ8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abraxas1Q8BPZ8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abraxas1Q8BPZ8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abraxas1Q8BPZ8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abraxas1Q8BPZ8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abraxas1Q8BPZ8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abraxas1Q8BPZ8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abraxas1Q8BPZ8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abraxas1Q8BPZ8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abraxas1Q8BPZ8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abraxas1Q8BPZ8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Abraxas1Q8BPZ8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abraxas1Q8BPZ8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abraxas1Q8BPZ8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abraxas1Q8BPZ8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abraxas1Q8BPZ8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abraxas1Q8BPZ8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abraxas1Q8BPZ8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abraxas1Q8BPZ8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abraxas1Q8BPZ8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms