Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Hirip3Q8BLH7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hirip3Q8BLH7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hirip3Q8BLH7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hirip3Q8BLH7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hirip3Q8BLH7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hirip3Q8BLH7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hirip3Q8BLH7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hirip3Q8BLH7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hirip3Q8BLH7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hirip3Q8BLH7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hirip3Q8BLH7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hirip3Q8BLH7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hirip3Q8BLH7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hirip3Q8BLH7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hirip3Q8BLH7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hirip3Q8BLH7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hirip3Q8BLH7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hirip3Q8BLH7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hirip3Q8BLH7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hirip3Q8BLH7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hirip3Q8BLH7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hirip3Q8BLH7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hirip3Q8BLH7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hirip3Q8BLH7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hirip3Q8BLH7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hirip3Q8BLH7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hirip3Q8BLH7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hirip3Q8BLH7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hirip3Q8BLH7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hirip3Q8BLH7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hirip3Q8BLH7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hirip3Q8BLH7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hirip3Q8BLH7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hirip3Q8BLH7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hirip3Q8BLH7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hirip3Q8BLH7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hirip3Q8BLH7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Hirip3Q8BLH7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hirip3Q8BLH7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hirip3Q8BLH7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hirip3Q8BLH7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hirip3Q8BLH7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Hirip3Q8BLH7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hirip3Q8BLH7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hirip3Q8BLH7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hirip3Q8BLH7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hirip3Q8BLH7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hirip3Q8BLH7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hirip3Q8BLH7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hirip3Q8BLH7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hirip3Q8BLH7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hirip3Q8BLH7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Hirip3Q8BLH7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hirip3Q8BLH7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Hirip3Q8BLH7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hirip3Q8BLH7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hirip3Q8BLH7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hirip3Q8BLH7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hirip3Q8BLH7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hirip3Q8BLH7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hirip3Q8BLH7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hirip3Q8BLH7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hirip3Q8BLH7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hirip3Q8BLH7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hirip3Q8BLH7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hirip3Q8BLH7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hirip3Q8BLH7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hirip3Q8BLH7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hirip3Q8BLH7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hirip3Q8BLH7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hirip3Q8BLH7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hirip3Q8BLH7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hirip3Q8BLH7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hirip3Q8BLH7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hirip3Q8BLH7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hirip3Q8BLH7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hirip3Q8BLH7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hirip3Q8BLH7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hirip3Q8BLH7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hirip3Q8BLH7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hirip3Q8BLH7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hirip3Q8BLH7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hirip3Q8BLH7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hirip3Q8BLH7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hirip3Q8BLH7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hirip3Q8BLH7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hirip3Q8BLH7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hirip3Q8BLH7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hirip3Q8BLH7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hirip3Q8BLH7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hirip3Q8BLH7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hirip3Q8BLH7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hirip3Q8BLH7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hirip3Q8BLH7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hirip3Q8BLH7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hirip3Q8BLH7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hirip3Q8BLH7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hirip3Q8BLH7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hirip3Q8BLH7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.8 ms