Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Usp54Q8BL06 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Usp54Q8BL06 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Usp54Q8BL06 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Usp54Q8BL06 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Usp54Q8BL06 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Usp54Q8BL06 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Usp54Q8BL06 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Usp54Q8BL06 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Usp54Q8BL06 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Usp54Q8BL06 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Usp54Q8BL06 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Usp54Q8BL06 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Usp54Q8BL06 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Usp54Q8BL06 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Usp54Q8BL06 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Usp54Q8BL06 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Usp54Q8BL06 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Usp54Q8BL06 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Usp54Q8BL06 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Usp54Q8BL06 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Usp54Q8BL06 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Usp54Q8BL06 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Usp54Q8BL06 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Usp54Q8BL06 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Usp54Q8BL06 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Usp54Q8BL06 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Usp54Q8BL06 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Usp54Q8BL06 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Usp54Q8BL06 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Usp54Q8BL06 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Usp54Q8BL06 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Usp54Q8BL06 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Usp54Q8BL06 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Usp54Q8BL06 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Usp54Q8BL06 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Usp54Q8BL06 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Usp54Q8BL06 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Usp54Q8BL06 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Usp54Q8BL06 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Usp54Q8BL06 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Usp54Q8BL06 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Usp54Q8BL06 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Usp54Q8BL06 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Usp54Q8BL06 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Usp54Q8BL06 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Usp54Q8BL06 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Usp54Q8BL06 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Usp54Q8BL06 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Usp54Q8BL06 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Usp54Q8BL06 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Usp54Q8BL06 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Usp54Q8BL06 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Usp54Q8BL06 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Usp54Q8BL06 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Usp54Q8BL06 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Usp54Q8BL06 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Usp54Q8BL06 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Usp54Q8BL06 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Usp54Q8BL06 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Usp54Q8BL06 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Usp54Q8BL06 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Usp54Q8BL06 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Usp54Q8BL06 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Usp54Q8BL06 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Usp54Q8BL06 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Usp54Q8BL06 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Usp54Q8BL06 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Usp54Q8BL06 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Usp54Q8BL06 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Usp54Q8BL06 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Usp54Q8BL06 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Usp54Q8BL06 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Usp54Q8BL06 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
Usp54Q8BL06 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Usp54Q8BL06 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Usp54Q8BL06 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Usp54Q8BL06 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Usp54Q8BL06 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Usp54Q8BL06 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Usp54Q8BL06 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Usp54Q8BL06 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Usp54Q8BL06 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Usp54Q8BL06 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Usp54Q8BL06 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Usp54Q8BL06 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Usp54Q8BL06 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Usp54Q8BL06 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Usp54Q8BL06 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Usp54Q8BL06 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Usp54Q8BL06 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Usp54Q8BL06 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Usp54Q8BL06 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Usp54Q8BL06 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Usp54Q8BL06 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Usp54Q8BL06 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Usp54Q8BL06 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Usp54Q8BL06 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Usp54Q8BL06 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Usp54Q8BL06 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms