Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zcchc4Q8BKW4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zcchc4Q8BKW4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zcchc4Q8BKW4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zcchc4Q8BKW4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Zcchc4Q8BKW4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Zcchc4Q8BKW4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Zcchc4Q8BKW4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Zcchc4Q8BKW4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Zcchc4Q8BKW4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Zcchc4Q8BKW4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Zcchc4Q8BKW4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zcchc4Q8BKW4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zcchc4Q8BKW4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zcchc4Q8BKW4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zcchc4Q8BKW4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zcchc4Q8BKW4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zcchc4Q8BKW4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zcchc4Q8BKW4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zcchc4Q8BKW4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zcchc4Q8BKW4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms