Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
D130040H23RikQ8BII3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
D130040H23RikQ8BII3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
D130040H23RikQ8BII3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
D130040H23RikQ8BII3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
D130040H23RikQ8BII3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
D130040H23RikQ8BII3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
D130040H23RikQ8BII3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
D130040H23RikQ8BII3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
D130040H23RikQ8BII3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
D130040H23RikQ8BII3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
D130040H23RikQ8BII3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
D130040H23RikQ8BII3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
D130040H23RikQ8BII3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
D130040H23RikQ8BII3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
D130040H23RikQ8BII3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
D130040H23RikQ8BII3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
D130040H23RikQ8BII3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
D130040H23RikQ8BII3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
D130040H23RikQ8BII3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
D130040H23RikQ8BII3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
D130040H23RikQ8BII3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
D130040H23RikQ8BII3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
D130040H23RikQ8BII3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
D130040H23RikQ8BII3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
D130040H23RikQ8BII3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
D130040H23RikQ8BII3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
D130040H23RikQ8BII3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
D130040H23RikQ8BII3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
D130040H23RikQ8BII3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
D130040H23RikQ8BII3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
D130040H23RikQ8BII3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
D130040H23RikQ8BII3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
D130040H23RikQ8BII3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
D130040H23RikQ8BII3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
D130040H23RikQ8BII3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
D130040H23RikQ8BII3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
D130040H23RikQ8BII3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
D130040H23RikQ8BII3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
D130040H23RikQ8BII3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
D130040H23RikQ8BII3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
D130040H23RikQ8BII3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
D130040H23RikQ8BII3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
D130040H23RikQ8BII3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
D130040H23RikQ8BII3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
D130040H23RikQ8BII3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
D130040H23RikQ8BII3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
D130040H23RikQ8BII3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
D130040H23RikQ8BII3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
D130040H23RikQ8BII3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
D130040H23RikQ8BII3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
D130040H23RikQ8BII3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
D130040H23RikQ8BII3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
D130040H23RikQ8BII3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
D130040H23RikQ8BII3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
D130040H23RikQ8BII3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
D130040H23RikQ8BII3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
D130040H23RikQ8BII3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
D130040H23RikQ8BII3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
D130040H23RikQ8BII3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
D130040H23RikQ8BII3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
D130040H23RikQ8BII3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
D130040H23RikQ8BII3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
D130040H23RikQ8BII3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
D130040H23RikQ8BII3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
D130040H23RikQ8BII3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
D130040H23RikQ8BII3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
D130040H23RikQ8BII3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
D130040H23RikQ8BII3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
D130040H23RikQ8BII3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
D130040H23RikQ8BII3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
D130040H23RikQ8BII3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
D130040H23RikQ8BII3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
D130040H23RikQ8BII3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
D130040H23RikQ8BII3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
D130040H23RikQ8BII3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
D130040H23RikQ8BII3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
D130040H23RikQ8BII3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
D130040H23RikQ8BII3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
D130040H23RikQ8BII3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
D130040H23RikQ8BII3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
D130040H23RikQ8BII3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
D130040H23RikQ8BII3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
D130040H23RikQ8BII3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
D130040H23RikQ8BII3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
D130040H23RikQ8BII3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
D130040H23RikQ8BII3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
D130040H23RikQ8BII3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
D130040H23RikQ8BII3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
D130040H23RikQ8BII3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
D130040H23RikQ8BII3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
D130040H23RikQ8BII3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
D130040H23RikQ8BII3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
D130040H23RikQ8BII3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
D130040H23RikQ8BII3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
D130040H23RikQ8BII3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
D130040H23RikQ8BII3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
D130040H23RikQ8BII3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
D130040H23RikQ8BII3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
D130040H23RikQ8BII3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 371.8 ms