Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gabra5Q8BHJ7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gabra5Q8BHJ7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms