Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHE5

Bmp3, Bone morphogenetic protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp3Q8BHE5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bmp3Q8BHE5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bmp3Q8BHE5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bmp3Q8BHE5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bmp3Q8BHE5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bmp3Q8BHE5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Bmp3Q8BHE5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bmp3Q8BHE5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bmp3Q8BHE5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bmp3Q8BHE5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bmp3Q8BHE5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bmp3Q8BHE5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bmp3Q8BHE5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bmp3Q8BHE5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bmp3Q8BHE5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bmp3Q8BHE5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bmp3Q8BHE5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bmp3Q8BHE5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bmp3Q8BHE5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bmp3Q8BHE5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bmp3Q8BHE5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bmp3Q8BHE5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bmp3Q8BHE5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bmp3Q8BHE5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Bmp3Q8BHE5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bmp3Q8BHE5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bmp3Q8BHE5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bmp3Q8BHE5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bmp3Q8BHE5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bmp3Q8BHE5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bmp3Q8BHE5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bmp3Q8BHE5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bmp3Q8BHE5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bmp3Q8BHE5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bmp3Q8BHE5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bmp3Q8BHE5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bmp3Q8BHE5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bmp3Q8BHE5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bmp3Q8BHE5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bmp3Q8BHE5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bmp3Q8BHE5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bmp3Q8BHE5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bmp3Q8BHE5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bmp3Q8BHE5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bmp3Q8BHE5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Bmp3Q8BHE5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bmp3Q8BHE5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bmp3Q8BHE5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bmp3Q8BHE5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bmp3Q8BHE5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bmp3Q8BHE5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bmp3Q8BHE5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bmp3Q8BHE5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bmp3Q8BHE5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bmp3Q8BHE5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bmp3Q8BHE5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bmp3Q8BHE5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bmp3Q8BHE5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bmp3Q8BHE5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bmp3Q8BHE5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bmp3Q8BHE5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bmp3Q8BHE5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bmp3Q8BHE5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bmp3Q8BHE5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bmp3Q8BHE5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bmp3Q8BHE5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bmp3Q8BHE5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bmp3Q8BHE5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bmp3Q8BHE5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bmp3Q8BHE5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bmp3Q8BHE5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bmp3Q8BHE5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bmp3Q8BHE5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bmp3Q8BHE5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Bmp3Q8BHE5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bmp3Q8BHE5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bmp3Q8BHE5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bmp3Q8BHE5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bmp3Q8BHE5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bmp3Q8BHE5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bmp3Q8BHE5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bmp3Q8BHE5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bmp3Q8BHE5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bmp3Q8BHE5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bmp3Q8BHE5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bmp3Q8BHE5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Bmp3Q8BHE5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Bmp3Q8BHE5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Bmp3Q8BHE5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bmp3Q8BHE5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bmp3Q8BHE5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bmp3Q8BHE5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bmp3Q8BHE5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bmp3Q8BHE5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bmp3Q8BHE5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bmp3Q8BHE5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bmp3Q8BHE5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Bmp3Q8BHE5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bmp3Q8BHE5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bmp3Q8BHE5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms