Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2af1l4Q8BGJ9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2af1l4Q8BGJ9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2af1l4Q8BGJ9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2af1l4Q8BGJ9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
U2af1l4Q8BGJ9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2af1l4Q8BGJ9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2af1l4Q8BGJ9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2af1l4Q8BGJ9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2af1l4Q8BGJ9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2af1l4Q8BGJ9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2af1l4Q8BGJ9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2af1l4Q8BGJ9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
U2af1l4Q8BGJ9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
U2af1l4Q8BGJ9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
U2af1l4Q8BGJ9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2af1l4Q8BGJ9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2af1l4Q8BGJ9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2af1l4Q8BGJ9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2af1l4Q8BGJ9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2af1l4Q8BGJ9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
U2af1l4Q8BGJ9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2af1l4Q8BGJ9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2af1l4Q8BGJ9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2af1l4Q8BGJ9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2af1l4Q8BGJ9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2af1l4Q8BGJ9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2af1l4Q8BGJ9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2af1l4Q8BGJ9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2af1l4Q8BGJ9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2af1l4Q8BGJ9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2af1l4Q8BGJ9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2af1l4Q8BGJ9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2af1l4Q8BGJ9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2af1l4Q8BGJ9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2af1l4Q8BGJ9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2af1l4Q8BGJ9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2af1l4Q8BGJ9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2af1l4Q8BGJ9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2af1l4Q8BGJ9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2af1l4Q8BGJ9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2af1l4Q8BGJ9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2af1l4Q8BGJ9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2af1l4Q8BGJ9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2af1l4Q8BGJ9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2af1l4Q8BGJ9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2af1l4Q8BGJ9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2af1l4Q8BGJ9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
U2af1l4Q8BGJ9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
U2af1l4Q8BGJ9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
U2af1l4Q8BGJ9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
U2af1l4Q8BGJ9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
U2af1l4Q8BGJ9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
U2af1l4Q8BGJ9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
U2af1l4Q8BGJ9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
U2af1l4Q8BGJ9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
U2af1l4Q8BGJ9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
U2af1l4Q8BGJ9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
U2af1l4Q8BGJ9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
U2af1l4Q8BGJ9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
U2af1l4Q8BGJ9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
U2af1l4Q8BGJ9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
U2af1l4Q8BGJ9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
U2af1l4Q8BGJ9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
U2af1l4Q8BGJ9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25■■□□□ 1.59
U2af1l4Q8BGJ9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
U2af1l4Q8BGJ9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
U2af1l4Q8BGJ9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
U2af1l4Q8BGJ9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
U2af1l4Q8BGJ9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
U2af1l4Q8BGJ9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
U2af1l4Q8BGJ9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
U2af1l4Q8BGJ9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
U2af1l4Q8BGJ9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
U2af1l4Q8BGJ9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2af1l4Q8BGJ9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2af1l4Q8BGJ9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2af1l4Q8BGJ9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2af1l4Q8BGJ9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2af1l4Q8BGJ9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2af1l4Q8BGJ9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2af1l4Q8BGJ9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2af1l4Q8BGJ9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2af1l4Q8BGJ9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2af1l4Q8BGJ9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
U2af1l4Q8BGJ9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
U2af1l4Q8BGJ9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
U2af1l4Q8BGJ9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
U2af1l4Q8BGJ9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
U2af1l4Q8BGJ9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
U2af1l4Q8BGJ9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
U2af1l4Q8BGJ9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
U2af1l4Q8BGJ9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
U2af1l4Q8BGJ9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
U2af1l4Q8BGJ9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms